Podcasts about proteomik

Thu, 20 Mar 2025 06:00:00 +0000 https://beyondlifespan.podigee.io/56-neue-episode bd25408583416dc223561ea7136827d4 Verstehe, wie Proteine als Biomarker dienen und personalisierte Medizin ermöglichen Hast du dich jemals gefragt, wie sehr dein Lebensstil deine Gene (und vor allem deine Proteine) beeinflusst? In dieser Episode spreche ich (Mario) mit Dr. Moritz Völker-Albert über genau dieses Thema. Proteomik ist nämlich ein spannender Forschungsbereiche, der uns helfen kann, Gesundheit besser zu verstehen und vor allem zu messen. Du hast Kooperationsanfragen, Themenvorschläge oder Feedback? Schreib uns eine E-Mail an podcast@beyondlifespan.de oder lass uns einen Kommentar auf der Plattform deiner Wahl da (YouTube, Spotify, Apple Podcasts etc.). Beyond Lifespan gibt es auch auf Instagram Mehr Infos zu unserer Person findest du hier: LinkedIn Mario LinkedIn Moritz Sponsor: MOLEQLAR Longevity Supplements und Tests: moleqlar.com Wir freuen uns außerdem sehr über Bewertungen und Weiterempfehlungen an Familie und Freunde - vielen Dank! full Verstehe, wie Proteine als Biomarker dienen und personalisierte Medizin ermöglichen no

In Ausgabe 70 des Science Busters Podcast besprechen Kabarettist Martin Puntigam, die Biochemikerin Prof. Ruth Birner-Grünberger von der TU-Wien und anorganische Chemiker Peter Weinberger, ebenfalls TU-Wien, wie man Metabolomikerin wird und was man dann ist, warum Elektrospray hilft, dem Fettstoffwechsel auf die Schliche zu kommen, wie elektrisch der Nasenschleim von Allergiker:innen ist, woraus Pollen eigentlich bestehen, wie man die Chemie des Lebens analysiert, warum eine Mischung aus Chloroform und Methanol zwar fettlösend ist, aber nicht beim Abnehmen hilft, wann unser Gesicht geflutet wird, wann die nächste Ausgabe der Zeitschrift „Der Bunsenbrenner“ erscheint und ob ein anorganischer Chemiker für eine Biochemikerin supplieren könnte

Valkeaoja och Gudiol gästas den här veckan av professor Christer Malm för att diskutera hans forskarkarriär med fokus på hans senaste arbete med att detektera bloddoping med hjälp av proteomik. Förutom att du får lära dig det mesta kring bloddoping så får du även höra om Christers tidigare forskning på träningsvärk och vad han tror är det mest sannolika förklaringen till varför det ibland uppstår efter träning. På Tyngre Träningssnacks instagram kan du hitta bilder relaterat till detta (och tidigare) avsnitt. Hålltider 00:00:00 Halsont, isolering och bottenrekord i steg från Gudiol 00:03:36 Boken Spring finns nu i tryckt format i bokhandeln och på Tyngre.se 00:06:08 Veckans gäst, professor Christer Malm 00:06:54 Universitetsutbildningen är mestadels på distans i Umeå 00:07:58 Christers bakgrund inom idrotten och studier på idrottsfysiologi 00:12:13 Doktorandstudier under Björn Ekbom mfl på Karolinska 00:14:15 Ingen tillgång till enskilda studier och inga möjligheter till omtentor i USA på 90-talet 00:18:06 Doktorsavhandling på skadorna som sker vid excentrisk träning 00:20:29 Träningsvärk beror inte på inflammation 00:25:05 Är det svullnaden i musklerna som ger tryck på muskelhinnorna? 00:27:31 Christers nuvarande forskning på bloddoping 00:30:28 Proteomik för att se hur olika åtgärder förändrar protein i kroppen 00:31:09 Forskning på styrkeidrottare som har tagit steroider 00:35:03 Första tanken kring att försöka detektera bloddoping via proteomik 00:37:45 Blod måste frysas om det ska göra någon nytta vid bloddoping 00:40:49 Ny teknik som gjorde en mätning snabbare och billigare 00:42:40 Vad är bloddoping och varför vill idrottare göra det? 00:46:44 Med proteomik kan vi se bevis för att blodet varit nedfryst 00:51:44 Blodpassen kan inte detektera bloddoping som utförs på "rätt vis" 00:54:38 Hur säkert är det att någon har dopat sig om de fastnar i testet? 01:02:52 Arbetet nu framöver och förhoppningen om att det ska fungera bra i andra labb 01:05:53 Kommer testet att vara redo inför OS? 01:08:52 Blir idrottare informerade om när det införs nya testmetoder? 01:11:04 Vad kan tänkas bidra till att människor faktiskt väljer att dopa sig? 01:18:30 Projektet har tagit lång tid men nu börjar det bli något riktigt konkret

Forskaren Fredrik Levander vill förbättra metoderna för att mäta vilka proteiner som finns i cellerna hos till exempel en tjur eller en potatis. Om vi ser generna som en bok med recept, så är proteinerna, som generna ger upphov till, ingredienserna som samspelar och avgör vilka egenskaper en organism får. Proteinerna fungerar som byggstenar, signalsystemskomponenter och enzymer som styr biokemiska processer. Fredrik tänker sig att proteinanalyser ska fungera som ett komplement till DNA-analyser inom växtförädling och djuravel, för att välja ut rätt individer.

In der Biologie oder Medizin sind Biomarker messbare Produkte von Organismen, die als Indikatoren z. B. für Umweltbelastungen oder Krankheiten herangezogen werden.

In der Biologie oder Medizin sind Biomarker messbare Produkte von Organismen, die als Indikatoren z. B. für Umweltbelastungen oder Krankheiten herangezogen werden.

Im Rahmen dieser Arbeit wurden unterschiedliche Proteomstudien an Halobacterium salinarum durchgeführt, die sich generell in drei unabhängige Themenblöcke unterteilen lassen. Zunächst erfolgte die Erfassung des cytosolischen Proteoms auf standardisierten 2-D Gelen. Hierfür wurde die Auftrennung auf sogenannten Zoom-Gelen aufgrund der engen pI-Verteilung halobakterieller Proteine etabliert. Die erschöpfende Analyse der so aufgetrennten Proteine wurde mit der peptide mass fingerprinting Methode im Hochdurchsatzverfahren durchgeführt. So konnten so 40% des zugänglichen cytosolischen Proteininventars identifiziert und auf Referenz 2-D Gelen kartiert werden. Des Weiteren konnten die massenspektrometrischen Proteinidentifizierungen zur intensiven Verbesserung der in vielen Fällen nicht eindeutigen Genomannotation herangezogen werden. Durch die Korrelationsanalyse von experimentellen und theoretischen pI-Werten konnten weitere Annotationsfehler behoben werden. Das Zusammenspiel von Genomik und Proteomik erlaubte die Identifizierung eines Bereichs ehemaliger Plasmid DNA, die in das Chromosom eingewandert ist. Weiter konnte für ein Plasmid gezeigt werden, dass dieser ehemalig chromosomale DNA und somit eine Reihe wichtiger und essentieller Gene enthält und deshalb eher als zweites Chromosom angesehen werden sollte. Nach der Inventarisierung folgten Analysen zur differentiellen Expression cytosolischer Proteine in Abhängigkeit unterschiedlicher Wachstumszustände. Hierbei wurde das aerobe Wachstum unter Standardbedingungen mit Wachstum unter Mangelbedingungen wie in synthetischem Medium oder unter anaeroben phototrophen Bedingungen verglichen. Bei der Analyse dieser Zustände mittels 2-DE konnten nur wenig regulierte Proteine identifiziert werden. Generell stellte sich die 2-DE aufgrund schwankender Reproduzierbarkeit und des geringen dynamischen Bereichs der gewählten Färbemethode für diese vergleichenden Analysen als wenig geeignet heraus. Die Verwendung isotopenmarkierter Sonden erlaubte hingegen einen detaillierten Einblick in die Regulationen auf Proteomebene unter besagten Bedingungen. Mit dem methodischen Ansatz der 1D-SDS PAGE LC-MALDI-TOF/TOF Analyse konnten von einem beträchtlichen Teil (ca. 40%) des cytosolischen Proteoms Regulationsinformationen erhalten werden. Auch hier zeigte sich, dass unter anaeroben phototrophen Bedingungen überraschend wenige Proteine reguliert werden müssen, damit sich der Organismus auf diese Lebensbedingung einstellen kann. Wachstum unter Nährstoffmangel in synthetischem Medium induziert überwiegend Proteine der Aminosäure- und Nukleotid-Biosynthese sowie Proteine, die am Proteinschutz und der Glykolyse beteiligt sind. Unter Standardwachstum wurden Proteine als induziert identifiziert, die bei nicht ausreichendem Vorhandensein wachstumslimitierend wirken würden. Dies waren hauptsächlich Enzyme der Thiamin und Cobalamin Biosynthese sowie des Peptid-Transportes und -Abbaues. Auch die CO2-Fixierung und die nachfolgende Gluconeogenese sind induziert. Durch die Verwendung unterschiedlicher Proteomik Ansätze konnte am Ende der Großteil der cytosolischen Proteine von H. salinarum identifiziert werden. Es scheinen nahezu alle chromosomalen Proteine auch unter Standard Wachstumsbedingungen expremiert zu werden, was starke Regulationen der Proteinkonzentrationen in Abhängigkeit unterschiedlicher Lebensbedingungen nicht notwendig macht. Der Organismus kann sich so schnell ohne großen energetischen Aufwand an wechselnde Lebensbedingungen anpassen. Im letzten Teil dieser Arbeit wurde das Ausmaß der Proteinphosphorylierung in H. salinarum untersucht. Hierbei konnten zunächst über radioaktive in vivo Markierung phosphattragende Proteine identifiziert werden. Ebenfalls gelang es, die ersten halobakteriellen Serin und Threonin Phosphorylierungsstellen zu identifizieren. Generell zeigte sich jedoch, dass das Ausmaß der Proteinphosphorylierung in H. salinarum eher gering ist. Bei den identifizierten Phosphorylierungen handelte es sich ausschließlich um katalytische Zwischenprodukte. Für die Existenz von regulativen Ser/Thr oder Tyr Proteinphosphorylierungen waren keine eindeutigen Hinweise zu finden. Weiter gelang es, eine Vielzahl von N-terminal acetylierten Proteinen als eine weitere Form der posttranslationalen Modifikationen zu identifizieren.