Podcasts about immunoblot

BUFFALO, NY- March 4, 2024 – A new #research paper was #published in Oncotarget's Volume 15 on February 22, 2024, entitled, “Sacituzumab govitecan plus platinum-based chemotherapy mediates significant antitumor effects in triple-negative breast, urinary bladder, and small-cell lung carcinomas.” Sacituzumab govitecan (SG) is an antibody-drug conjugate composed of an anti-Trop-2-directed antibody conjugated with the topoisomerase I inhibitory drug, SN-38, via a proprietary hydrolysable linker. SG has received United States Food and Drug Administration (FDA) approval to treat metastatic triple-negative breast cancer (TNBC), unresectable locally advanced or metastatic hormone receptor (HR)-positive, human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-negative breast cancer, and accelerated approval for metastatic urothelial cancer (mUC). In this new study, researchers Thomas M. Cardillo, Maria B. Zalath, Roberto Arrojo, Robert M. Sharkey, Serengulam V. Govindan, Chien-Hsing Chang, and David M. Goldenberg from Gilead Sciences and the Center for Molecular Medicine and Immunology investigated the utility of combining SG with platinum-based chemotherapeutics in TNBC, urinary bladder carcinoma (UBC), and small-cell lung carcinoma (SCLC). “Given recent FDA approval of SG in mTNBC and accelerated approval in mUC [metastatic urothelial cancer], as well as its demonstrated clinical activity in SCLC [11], we investigated the possibility of expanding use of SG through combinations with currently utilized chemotherapeutics for these disease indications.” SG plus carboplatin or cisplatin produced additive growth-inhibitory effects in vitro that trended towards synergy. Immunoblot analysis of cell lysates suggests perturbation of the cell-cycle and a shift towards pro-apoptotic signaling evidenced by an increased Bax to Bcl-2 ratio and down-regulation of two anti-apoptotic proteins, Mcl-1 and survivin. Significant antitumor effects were observed with SG plus carboplatin in mice bearing TNBC or SCLC tumors compared to all controls (P < 0.0062 and P < 0.0017, respectively) and with SG plus cisplatin in UBC and SCLC tumor-bearing animals (P < 0.0362 and P < 0.0001, respectively). These combinations were well tolerated by the animals. “Combining SG with platinum-based chemotherapeutics demonstrates the benefit in these indications and warrants further clinical investigation.” DOI - https://doi.org/10.18632/oncotarget.28559 Correspondence to - Thomas M. Cardillo - Thomas.Cardillo1@Gilead.com Sign up for free Altmetric alerts about this article - https://oncotarget.altmetric.com/details/email_updates?id=10.18632%2Foncotarget.28559 Subscribe for free publication alerts from Oncotarget - https://www.oncotarget.com/subscribe/ Keywords - cancer, sacituzumab govitecan, Trop-2, SN-38, carboplatin, cisplatin About Oncotarget Oncotarget (a primarily oncology-focused, peer-reviewed, open access journal) aims to maximize research impact through insightful peer-review; eliminate borders between specialties by linking different fields of oncology, cancer research and biomedical sciences; and foster application of basic and clinical science. To learn more about Oncotarget, please visit https://www.oncotarget.com and connect with us: Facebook - https://www.facebook.com/Oncotarget/ X - https://twitter.com/oncotarget Instagram - https://www.instagram.com/oncotargetjrnl/ YouTube - https://www.youtube.com/@OncotargetJournal LinkedIn - https://www.linkedin.com/company/oncotarget Pinterest - https://www.pinterest.com/oncotarget/ Reddit - https://www.reddit.com/user/Oncotarget/ Spotify - https://open.spotify.com/show/0gRwT6BqYWJzxzmjPJwtVh Media Contact MEDIA@IMPACTJOURNALS.COM 18009220957

Link to bioRxiv paper: http://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.11.21.392449v1?rss=1 Authors: Baik, S.-H., Selvaraji, S., Fann, D. Y., Jo, D.-G., Herr, D. R., Lai, M. K. P., Chen, C. L.-H., Drummond, G. R., Lim, K.-L., Sobey, C. G., Arumugam, T. Abstract: Vascular dementia (VaD) is a progressive cognitive impairment of vascular etiology. VaD is characterized by cerebral hypoperfusion, increased blood-brain barrier permeability and white matter lesions. An increased burden of VaD is expected due to rapidly aging populations. The hippocampus is particularly susceptible to hypoperfusion, and the resulting memory impairment may play a crucial role in VaD. Here we have investigated the hippocampal gene expression profile of young and old mice subjected to chronic cerebral hypoperfusion by bilateral common carotid artery stenosis (BCAS). Our data in sham-operated young and aged mice show the normal age-associated decline in cerebral blood flow and differential gene expression. BCAS and ageing caused broadly similar effects, however, BCAS-induced changes in hippocampal gene expression differed between young and aged mice. Specifically, transcriptomic analysis indicated that in comparison to young sham mice, many pathways altered by BCAS in young mice resembled those present in sham aged mice. Immunoblot analyses confirmed these findings. Finally, relative to young sham mice the cell type-specific profile of genes in both young BCAS and old sham animals further revealed common cell-specific genes. Our data provide a genetic-based molecular framework for chronic hypoperfusion-induced hippocampal damage and reveal common cellular signaling pathways likely to be important in the pathophysiology of VaD. Copy rights belong to original authors. Visit the link for more info

Link to bioRxiv paper: http://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.10.15.341115v1?rss=1 Authors: Tan, Y., Zhao, X., Zhao, J., Ji, Q., Xiao, L., Hao, D. Abstract: The polyphagous pest Apolygus lucorumhas become the dominant insect in Bacillus thuringiensis (Bt) cotton fields. The hormone 20-hydroxyecdysone (20E) regulates multiple events in insect development and physiology. 20E responses are controlled by pathways triggered by phospholipase C (PLC)-associated proteins. However, 20E-modulated genes whose expression is affected by PLC remain unknown. Here, isobaric tag for relative and absolute quantitation (iTRAQ) and immunoblot were carried out for comparing differentially expressed proteins (DEPs) in A. lucorumin response to 20E and the PLC inhibitor U73122, respectively. Totally 1624 DEPs were, respectively, found in the 20E/control, U73122/control, and 20E+U73122/control groups. Venn diagram analysis further revealed 8 DEPs that were shared among the three groups. Immunoblot validated these findings, which corroborated and highlighted the reliability of proteomics. KEGG enrichment analysis showed that the DEPs were included in diverse signaling pathways. The largest portion of DEPs among the three groups were categorized in metabolic pathways. In addition, DEPs among the three groups were also found to regulate the Ras-MAPK and PI3K-AKT pathways. This is the first time that iTRAQ was carried out to assess proteome alteration in A. lucorum nymphs in response to 20E and a PLC inhibitor. These findings provide novel insights into protein expression in A. lucorumin response to 20E, and a more comprehensive understanding of the function of PLC in 20E signal transduction. Copy rights belong to original authors. Visit the link for more info

Why You Should Listen: In this episode, you will learn about the various testing options offered by IGeneX in the realm of vector-borne diseases. About My Guest: My guest for this episode is Dr. Jyotsna Shah. Dr. Jyotsna Shah PhD is the President and Laboratory Director of IGeneX Clinical Laboratory, Palo Alto, CA. Dr. Shah has over 40 years of research experience in immunology, molecular biology and microbiology, has been published, and holds more than 20 patents. After receiving her B.Sc. and M.Sc in Biological Sciences in the UK and her PhD. in diagnostic immunology from Nairobi University in Kenya, Dr. Shah joined the International Laboratory for Research on Animal Diseases (ILRAD) as a post-doctoral scientist and started the first DNA sequencing laboratory in East Africa. On completion of her fellowship, she went on to join Harvard University's Department of Tropical Medicine as a research fellow and continued work on development of molecular tools for diagnosis of parasitic diseases. Since then, Dr. Shah has worked at several Biotechnology companies focusing on the development of novel molecular technologies for diagnosis of infectious diseases and has become a world expert on use of Fluorescent in Situ Hybridization (FISH) technique for direct detection of pathogens in clinical samples. Dr. Shah joined IGeneX as the Director of Research and Development in 1997 and in 2003 became Laboratory Director. During her time with IGeneX, she introduced the first Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) test for Babesia and also set up the PCR department for tick-borne diseases. Under Dr. Shah's direction, the laboratory has developed an excellent QA program and with her scientific guidance, IGeneX has become the world's leading reference laboratory for diagnosis of tick-borne diseases. Dr. Shah is now the owner of IGeneX and continues her mission to help those struggling with vector-borne illnesses. Key Takeaways: - What is the history of IGeneX? - What is the difference between antibody and antigen testing? - Why is IgM and IgG in Borrelia not the same as other infectious conditions? - Why are bands 31 and 34 included in IGeneX Western Blots but not other commercial blots? - What is the difference between the Western Blot and the ImmunoBlot? - What is the importance of the Relapsing Fever Borrelia test options? - What testing does IGeneX offer in the realm of coinfections? - What is the IGXSpot and when might it be useful to consider? - What microbes where found in her research on Morgellons? - How can tick testing be performed with IGeneX? Connect With My Guest: http://www.IGeneX.com Interview Date: April 23, 2018 Disclaimer: The content of this show is for informational purposes only and is not intended to diagnose, treat, or cure any illness or medical condition. Nothing in today's discussion is meant to serve as medical advice or as information to facilitate self-treatment. As always, please discuss any potential health-related decisions with your own personal medical authority.

Multiple system atrophy is a parkinsonian neurodegenerative disorder. It is cytopathologically characterized by accumulation of the protein p25α in cell bodies of oligodendrocytes followed by accumulation of aggregated α-synuclein in so-called glial cytoplasmic inclusions. p25α is a stimulator of α-synuclein aggregation, and coexpression of α-synuclein and p25α in the oligodendroglial OLN-t40-AS cell line causes α-synuclein aggregate-dependent toxicity. In this study, we investigated whether the FAS system is involved in α-synuclein aggregate dependent degeneration in oligodendrocytes and may play a role in multiple system atrophy. Using rat oligodendroglial OLN-t40-AS cells we demonstrate that the cytotoxicity caused by coexpressing α-synuclein and p25α relies on stimulation of the death domain receptor FAS and caspase-8 activation. Using primary oligodendrocytes derived from PLP-α-synuclein transgenic mice we demonstrate that they exist in a sensitized state expressing pro-apoptotic FAS receptor, which makes them sensitive to FAS ligand-mediated apoptosis. Immunoblot analysis shows an increase in FAS in brain extracts from multiple system atrophy cases. Immunohistochemical analysis demonstrated enhanced FAS expression in multiple system atrophy brains notably in oligodendrocytes harboring the earliest stages of glial cytoplasmic inclusion formation. Oligodendroglial FAS expression is an early hallmark of oligodendroglial pathology in multiple system atrophy that mechanistically may be coupled to α-synuclein dependent degeneration and thus represent a potential target for protective intervention.

Thu, 13 Dec 2012 12:00:00 +0100 https://edoc.ub.uni-muenchen.de/15282/ https://edoc.ub.uni-muenchen.de/15282/1/Bott-Fluegel_Christiane.pdf Bott-Flügel, C

Ein bedeutender Mechanismus zur Prävention und Regression von atherosklerotischen Läsionen ist die Abräumung von akkumulierten extrazellulären Lipiden in der Gefäßwand und deren Einschleusung in den reversen Cholesterintransport durch Makrophagen. Wichtigste molekulare Effektoren sind dabei Scavenger Rezeptoren wie CD36 und Cholesterin-Exporter wie ABCA1 und ABCG1. Deren Expression wird durch spezifische oxidierte Sterole, die die nukleären Transkriptionsfaktoren wie PPARgamma und LXRalpha aktivieren, induziert. Da hochdosierte lipidlösliche Antioxidantien diese regulatorischen Oxylipide beeinflussen könnten, war es Ziel dieser Arbeit am Makrophagen-Modell die Wirkung von hochdosiertem alpha-Tocopherol auf Signalwege und Schlüsselrezeptoren der Cholesterin-Homöostase zu untersuchen. Der Einfluss von alpha-Tocopherol und teilweise auch von gamma-Tocopherol wurde auf regulatorischer, transkriptioneller, translationeller und funktioneller Ebene mittels Realtime RT-PCR, Reportergen-Assays, FACS, Immunoblot und Lipidaufnahme- und Lipidefflux-Assays analysiert. Der LDL-R wurde durch hochdosiertes alpha-Tocopherol nicht beeinflusst, während die Expression des Scavenger Rezeptors CD36, konzentrationsabhängig sowohl auf mRNA-Ebene als auch auf Protein-Ebene durch alpha-Tocopherol beeinträchtigt wurde. Auf funktioneller Ebene verringerte alpha-Tocopherol die Aufnahme von [H³]-Cholesterin markiertem oxLDL durch Makrophagen. Der Effekt konnte ebenso mikroskopisch dargestellt werden. Die verminderte Expression von CD36 durch alpha-Tocopherol konnte zumindest teilweise durch eine dosisabhängige Verminderung der mRNA-Transkription von PPARγ und eine verminderte Aktivierung von PPARgamma im PPRE-Luziferase-Assay auch durch exogene Stimuli erklärt werden. gamma-Tocopherol hatte keinen vergleichbaren Effekt auf die CD36- und PPARgamma-spezifische mRNA, weswegen bereits auch ein direkter transkriptioneller Effekt von alpha-Tocopherol postuliert wurde. Die vermehrte zelluläre Aufnahme von oxidiertem LDL über Scavenger Rezeptoren wie CD36 induziert normalerweise auch eine vermehrte Einschleusung von Cholesterin in den reversen Cholesterintransport durch ABC-Exporter wie ABCA1 und ABCG1, wodurch die Schaumzellbildung zumindest verzögern werden kann. Diese Induktion der Cholesterin-Exporter wird durch oxidierte Sterole vermittelt, die LXRalpha aktivieren. Deshalb wurde ebenfalls eine mögliche Interferenz von hochdosiertem alpha-Tocopherol mit dem zellulären Cholesterin-Export untersucht. In der Tat wurde der Cholesterin-Efflux von Makrophagen auf delipidiertes HDL durch alpha-Tocopherol beeinträchtigt, wodurch der zelluläre Cholesterin-Bestand anstieg. Dieser Effekt zeigte auch mikroskopisch vermehrte Lipidgranula. Die Aktivierung des LXR-Response Elements im Luziferase-Assay durch exogene Stimuli wie 22-OHC oder oxidiertes LDL wurde durch alpha-Tocopherol ebenfalls negativ beeinflusst. Dadurch könnte die Reduktion der Expression von ABCA1 und ABCG1 auf mRNA-Ebene und von ABCA1 auf Proteinebene zumindest teilweise erklärt werden. Mit gamma-Tocopherol konnte nur eine geringe Reduktion auf mRNA Ebene, sowohl für ABCA1 als auch LXRalpha festgestellt werden. Bei der verminderten Expression von ABCA1 und ABCG1 durch hochdosiertes alpha-Tocopherol handelt es sich also wahrscheinlich um einen spezifischen, teilweise durch LXRalpha vermittelten Prozess. Es scheinen aber weitere Signalwege beteiligt zu sein: Unerwarteterweise wurde die Transkription und die Aktivierung von LXRalpha auch durch delipidiertes HDL stimuliert, was durch hochdosiertes alpha-Tocopherol ebenfalls dosisabhängig reduziert werden konnte. Nichtsdestotrotz war ABCA1 in Makrophagen nach Cholesterinverarmung durch delipidiertes HDL supprimiert. Die gefundenen Effekte von alpha-Tocopherol auf Schlüsselrezeptoren der Cholesterin-Homöostase in Makrophagen können zur Erklärung der enttäuschenden Resultate der Preventionsstudien mit hochdosiertem alpha-Tocopherol beitragen: Durch Hemmung des Scavenger Rezeptors CD36 reduziert alpha-Tocopherol zwar einerseits den ersten Schritt zur Schaumzellbildung um den Preis einer verzögerten Abräumung extrazellulärer Lipiddepots, alpha-Tocopherol verlangsamt aber auch durch Hemmung von ABCA1 und ABCG1, den endgültigen Abtransport von Cholesterin aus der Gefäßwand durch den reversen Cholesterin-Transport.

Extraintestinal pathogene Escherichia coli (ExPEC) sind die häufigsten Erreger von Harnwegsinfektionen beim Menschen. Darüber hinaus können sie eine Vielzahl weiterer Erkrankungen wie Pneumonie, Wundinfektion, Neugeborenenmeningitis oder Sepsis hervorrufen. Hierzu verfügen ExPEC über ein breites Repertoire von Pathogenitätsfaktoren wie Adhäsine, Toxine und Eisenaufnahmesysteme. Wesentlicher Bestandteil von Eisenaufnahmesystemen sind Rezeptoren in der bakteriellen Außenmembran, wie z. B. die Siderophorrezeptoren FyuA und IroN sowie der Häminrezeptor ChuA. Ihre Assoziation mit der Virulenz von ExPEC und die Lokalisation in der Außenmembran bzw. an der bakteriellen Oberfläche lassen Eisenaufnahmerezeptoren als geeignete Zielstrukturen eines Impfstoffes gegen ExPEC erscheinen. Die vorliegende Arbeit erbrachte grundlegende Erkenntnisse hinsichtlich der Eignung von Eisenaufnahmerezeptoren als potentielle Zielstrukturen, indem Seren von Patienten mit einer E. coli-Infektion und Seren aus dem Mausinfektionsmodell im Immunoblot auf Antikörper gegen FyuA, ChuA und IroN untersucht wurden. Hierzu wurde eine Sammlung von E. coli-Patientenisolaten und der entsprechenden Patientenseren angelegt. Die Isolate wurden mittels PCR hinsichtlich mehrerer ExPEC-assoziierter Gene, u. a. fyuA, chuA, iroN und usp charakterisiert. Im Immunoblot wurden dann die Seren auf Antikörper gegen die rekombinanten Proteine FyuA, IroN, ChuA und Usp getestet. Im Unterschied zu FyuA, ChuA und IroN handelt es sich bei dem zusätzlich untersuchten Usp um ein ExPEC-Protein mit bisher weitgehend unklarer Funktion. Die unterschiedliche Prävalenz von ExPEC-assoziierten Faktoren unter den Patientenisolaten konnte bestätigt werden. Es gelang erstmals, bei Patienten spezifische Antikörper gegen Eisenaufnahmerezeptoren von ExPEC nachzuweisen. Für die hierzu durchgeführten Immunoblot-Untersuchungen konnte in dieser Arbeit erstmals der Häminrezeptor ChuA rekombinant exprimiert und aufgereinigt werden. Die humorale Immunantwort gegen die einzelnen Eisenaufnahmerezeptoren wies ein relativ heterogenes Bild auf. Während bei den Patienten einerseits Antikörper unter der Infektion gebildet wurden (ChuA), waren sie andererseits bei IroN offenbar schon vorher vorhanden oder konnten, wie für FyuA gezeigt, nicht nachgewiesen werden. Auch im Mausmodell der ExPEC-Peritonitis fanden sich nur Antikörper gegen IroN, die in einem entsprechenden Tiermodell der ExPEC Harnwegsinfektion nicht darstellbar waren. Aufgrund der Ergebnisse dieser Arbeit ist es denkbar, dass die Bildung von Antikörpern gegen ExPEC-Außenmembranproteine zum einen von der Intensität und der Dauer der Infektion und zum anderen von Unterschieden in der Expression und in der Immunogenität der einzelnen Eisenaufnahmerezeptor-Proteine abhängig ist. Es ist jedoch nicht völlig auszuschließen, dass auch methodische Gründe(z. B. bei der Durchführung des Immunoblots) die Antikörpernachweise negativ beeinflusst haben. Die Ergebnisse dieser Arbeit konnten die Bedeutung von Eisenaufnahmerezeptoren als potentielle Zielstrukturen eines Impfstoffes bestätigen. Insbesondere die Rolle von IroN wurde durch die Beobachtungen unterstrichen. Die unterschiedliche Prävalenz der einzelnen Eisenaufnahmesysteme unter ExPEC und die Unterschiede der humoralen Immunantwort deuten jedoch darauf hin, dass es nötig sein wird, einen polyvalenten Kombinationsimpfstoff herzustellen, der gleichzeitig gegen mehrere Eisenaufnahmerezeptoren sowie weitere Zielstrukturen wie Adhäsine und Toxine Antikörperantworten erzeugt

Objective: We evaluated whether immunoblotting is capable of substantiating the posttreatment clinical assessment of patients with erythema migrans ( EM), the hallmark of early Lyme borreliosis. Methods: In 50 patients, seroreactivity to different antigens of Borrelia burgdorferi sensu lato was analyzed by a recombinant immunoblot test (IB) in consecutive serum samples from a minimum follow-up period of 1 year. Antigens in the IgG test were decorin- binding protein A, internal fragment of p41 (p41i), outer surface protein C (OspC), p39, variable major protein-like sequence expressed (VlsE), p58 and p100; those in the IgM test were p41i, OspC and p39. Immune responses were correlated with clinical and treatment-related parameters. Results: Positive IB results were found in 50% before, in 57% directly after therapy and in 44% by the end of the follow-up for the IgG class, and in 36, 43 and 12% for the IgM class. In acute and convalescence phase sera, VlsE was most immunogenic on IgG testing 60 and 70%), and p41i (46 and 57%) and OspC (40 and 57%) for the IgM class. By the end of the follow-up, only the anti-p41i lgM response was significantly decreased to 24%. Conclusions: No correlation was found between IB results and treatment-related parameters. Thus, immunoblotting does not add to the clinical assessment of EM patients after treatment. Copyright (c) 2008 S. Karger AG, Basel.

The major goal of the project was the investigation of proteins that regulate dynamic rearrangements of the actin cytoskeleton in Dictyostelium discoideum amoebae. Among the proteins studied in detail were (i) D. discoideum vasodilator stimulated phosphoprotein DdVASP and a new profilin isoform as putative regulators of filopodia formation, and (ii) the Ste20-like kinases Krs1 and Severin-Kinase as members of signalling cascades towards the actin cytoskeleton. Filopodia are bundles of actin filaments projecting from the cell surface. They are found on a variety of cell types and are needed among others, for cell adhesion, sensory and exploratory functions. Filopodia are frequently found associated with sheet-like arrays of actin filaments called lamellipodia and membrane ruffles. The function of the VASP homolog from D. discoideum in filopodia formation was studied using molecular, biochemical and cell biological approaches. The protein sequence of DdVASP shares a significant homology to the members from other species. The protein harbours two Ena/VASP homology domains EVH1 and EVH2 separated by a polyproline stretch. The EVH2 domain is characterised by a G-actin binding site (GAB), an F-actin binding site (FAB) and a tetramerisation domain. As a tetramer the DdVASP protein can nucleate actin polymerization and bundle actin filaments. The in vitro nucleating activity of DdVASP is salt dependent and its nucleating activity is completely abolished at 100 mM salt. However, the F-actin bundling activity as determined by the low speed sedimentation assay was not disturbed. The ability of DdVASP to influence the binding of capping protein to the growing ends of the actin filaments was tested through elongation of capped F-actin seeds and by depolymerization of capped filaments upon dilution below the critical concentration of the barbed ends. Results from both sets of experiments showed that DdVASP cannot remove capping protein from the barbed ends. The D. discoideum formin dDia2, which was previously reported to be essential for filopodia formation could elongate the capped F-actin seeds. In vitro biochemical data led to the conclusion that the bundling activity of DdVASP is the essential in vivo function to stabilise actin filaments in emerging filopodia. To test this hypothesis, a DdVASP null mutant was isolated. As expected the mutant failed to produce any filopodia. Expression of wild type DdVASP, but not DdVASPFAB, rescued the phenotype suggesting the importance of the bundling activity of DdVASP in filopodia formation. To confirm that the data obtained with DdVASP were not species specific, key biochemical functions of HsVASP were also tested. The results indicated that VASPs are functionally well conserved throughout evolution. During this study, a third profilin isoform, profilin III, was further characterised. Specific interaction between profilin III and DdVASP was discovered. Profilin III shares a limited homology at the amino acid level with the other two and well studied profilins. Polyclonal antibodies that recognise only the profilin III isoform showed that in wild type cells profilin III represents less than 1% of all profilins. This suggests a distinct role for profilin III, because a low protein concentration argues against an actin sequestering function. Immunolocalisation studies showed profilin III in filopodia and enriched at their tips. Cells lacking the profilin III protein show defects in cell motility during chemotaxis. The second part of the project dealt with the characterisation of two D. discoideum Germinal Centre Kinases (GCK). The catalytic domain of Krs1 was found to be highly homologous to the catalytic region of human MST1 and MST2 from the GCK-II subfamily. The regulatory region harbours the putative inhibitory domain (aa 330-379) and a possible multimerization (SARAH) domain (aa 412-458) described for GCKs in higher organisms. This SARAH region spans about 50 amino acid residues, is located at the extreme carboxyl terminus and most likely forms an  - helical coiled-coil motif. GFP-Krs1 overexpressing wild type cells showed an enrichment of the kinase in the cell cortex, and motility of these cells during aggregation was reduced. Krs1 knockout strains exhibited only subtle differences to wild type cells. Severin kinase is encoded by the gene svkA, and phylogenetic analysis groups it into subfamily GCK-III, along with human MST3, MST4 and YSK/SOK-1. Immunoblot analysis with polyclonal antibodies showed an uniform expression level throughout development. Gene disruption of svkA resulted in cells that had problems to divide both in submerged or in shaking cultures. Though the motility and chemotaxis of these cells remain unaltered compared to the wild type cells, the movement of the multicellular slugs is disturbed. In addition, development was delayed and the mutant formed aberrant fruiting bodies.

Das epitheliale Zelladhäsionsmolekül EpCAM ist in der Tumorentstehung von Plattenepithelkarzinomen über- oder de novo exprimiert. Zudem korreliert die EpCAM-Expression in Tumorzellen positiv mit Proliferation und Entdifferenzierung. Es wurde in Vorarbeiten ein 1100 bp epcam-Promotorfragment kloniert, das spezifisch in EpCAM-positiven Zellen transkriptionell aktiv ist und durch TNFα in der Promotoraktivität reprimiert wird. In meiner Arbeit untersuchte ich, ob das 1100 bp epcam-Promotorfragment zur gezielten heterologen Genexpression geeignet ist. Zu diesem Zweck wurden drei Proteine ausgewählt: Grünes Fluoreszenz Protein (GFP), TNF receptor associated death domain Protein (TRADD) und Herpes Simplex Virus 1 Thymidinkinase (HSV1-TK). GFP diente der Visualisierung der Promotoraktivität im Fluoreszenzmikroskop. TRADD sollte die Apoptose in EpCAM-positiven Tumorzellen induzieren. Mit Hilfe der spezifischen Expression der HSV1-TK in EpCAM-positiven Zellen sollten Tumorzellen für Ganciclovir sensitiviert werden. Eine Therapie mit Ganciclovir sollte das Absterben der Tumorzellen bewirken. Die heterologe Genexpression wurde an einem zellulären Modellsystem von EpCAM-positiven und EpCAM-negativen HEK293 Zellen getestet. Dabei zeigten EpCAM-positive Zellen eine deutliche GFP-Expression, während EpCAM-negative Zellen sporadisch eine minimale Fluoreszenzintensität aufwiesen. Die EpCAM-spezifische Expression von GFP konnte im Immunoblot bestätigt werden. Um den Zusammenhang zwischen EpCAM- und GFP-Expression zu veranschaulichen, wurden die Ergebnisse der durchflusszytometrischen Messungen der EpCAM-Oberflächenexpression mit der GFP-Fluoreszenz verglichen. Damit konnte im zellulären Modellsystem von EpCAM-positiven und EpCAM-negativen HEK293 Zellen gezeigt werden, dass die epacm-Promotoraktivität zu einer heterologen Genexpression von GFP führt. Das zelluläre Modellsystem von EpCAM-positiven und EpCAM-negativen HEK293 Zellen wurde auf die Expression weiterer funktioneller Gene untersucht. Für das Funktionsgen TRADD konnte dabei weder eine EpCAM-spezifische heterologe Genexpression in der RT-PCR noch im Immunoblot nachgewiesen werden. In beiden Untersuchungen führten die Positivkontrollen zu einem Nachweis von TRADD. Da TRADD über komplexe Signalwege zur Bildung von TNFα führen kann, findet möglicherweise eine Inaktivierung des epcam-Promotors durch TNFα statt. Die heterologe Genexpression von HSV1-TK unter der Kontrolle des epcam-Promotors konnte im zellulären Modellsystem in der RT-PCR nachgewiesen und auf die EpCAM-positive Tumorzelllinie SKBR3 übertragen werden. Durch die Genexpression von HSV1-TK wurden EpCAM-positive HEK293 Transfektanten sensitiv gegenüber einer Behandlung mit Ganciclovir und zeigten eine deutlich reduzierte metabolische Aktivität im MTT-Ansatz bei Ganciclovirgabe. Dabei gewonnene Erkenntnisse wurden an der EpCAM-positiven Tumorzellinie SKBR3 bestätigt. Zusammengefasst konnte gezeigt werde, dass die heterologe Genexpression von HSV1-TK unter der Kontrolle des epcam-Promotors zu Ganciclovirsensitivität in EpCAM-positiven Zellen führte, jedoch nicht in EpCAM-negativen Zellen. Somit ist es denkbar, das 1100 bp epcam-Promotorfragment für die therapeutische Genexpression letaler Gene zur Elimination EpCAM-positiver Tumorzellen zu verwenden.

Channels of the plastid and mitochondrial outer membranes facilitate the turnover of molecules and ions via these membranes. Although channels have been studied many questions pertaining to the whole diversity of plastid and mitochondrial channels in Arabidopsis thaliana and Pisum sativum remain unanswered. In this thesis I studied OEP16, OEP37 and VDAC families in two model plants, in Arabidopsis and pea. The Arabidopsis OEP16 family represents four channels of α-helical structure, similar to the pea OEP16 protein. These channels are suggested to transport amino acids and compounds with primary amino groups. Immunoblot analysis, GFP/RFP protein fusion expression, as well as proteomic analysis showed that AtOEP16.1, AtOEP16.2 and AtOEP16.4 are located in the outer envelope membrane of plastids, while AtOEP16.3 is in mitochondria. The gene expression and immunoblot analyses revealed that AtOEP16.1 and AtOEP16.3 proteins are highly abundant and ubiquitous; expression of AtOEP16.1 is regulated by light and cold. AtOEP16.2 is highly expressed in pollen, seeds and seedlings. AtOEP16.4 is a low expressed housekeeping protein. Single knockout mutants of AtOEP16.1, AtOEP16.2 and AtOEP16.4, and double mutants of AtOEP16 gene family did not show any remarkable phenotype. However, macroarray analysis of Atoep16.1-p T-DNA mutant revealed 10 down-regulated and 6 up-regulated genes. In contrast to the α-helical OEP16 proteins, the OEP37 and VDAC proteins are of β-barrel structure. The PsOEP37 and AtOEP37 channel proteins form a selective barrier in the outer envelope of chloroplasts. Electrophysiological studies in lipid bilayer membranes showed that the PsOEP37 channel is permeable for cations. Specific expression profiles showed that AtOEP37 and PsOEP37 are highly expressed in the entire plant. The isolated PsVDAC gene encodes a protein, which is located in mitochondria. In Arabidopsis gene database, five Arabidopsis genes, which code for VDAC-like proteins were announced. One gene was not detected, whereas four of these genes expressed in leaves, roots, flower buds and pollen.

Der Tonus der glatten Muskulatur wird einerseits direkt durch Aktivierung des kontraktilen Apparates und andererseits über Veränderungen der intrazellulären Calciumkonzentration gesteuert. NO freisetzende Pharmaka aktivieren die lösliche Guanylylzyklase und führen über den cGMP/cGMP-Kinase abhängigen Signalweg zur Erschlaffung der glatten Muskulatur. Wie die Kinase dieses Signal vermittelt ist noch weitgehend unklar, wobei schon einige Substrate der cGMP-Kinase I bekannt sind. In der Mikrosomenfraktion glatter Muskeln wurde ein stabiler Komplex der cGMP-Kinase I und ihrer Substrate IRAG und IP3-Rezeptor Typ I beschrieben, der für die Steuerung des Calciumausstroms aus Speichern des sarkoplasmatischen Retikulums verantwortlich ist. In der vorliegenden Arbeit sollte dieser mikrosomale Komplex genauer untersucht und die beteiligten Proteine gereinigt und charakterisiert werden. Dies geschah vor allem durch Co- Immunpräzipitationen mit spezifischen Antikörpern und Affinitätschromatographie mit cGMP-Agarose. Die Identifizierung der gereinigten Proteine erfolgte durch MALDI-TOF Analyse und Immunoblot, wobei Substrate der Kinase nach cGMP-abhängiger Phosphorylierung mit radioaktiv markiertem ATP detektiert wurden. Der Komplex wurde aus dem glatten Muskel der Trachea von Rindern aufgereinigt und seine Bestandteile isoliert. Dabei ergab sich die Assoziation von Phospholamban, einem Substrat der cGMP-Kinase, das den Calcium Rücktransport durch die Ca2+-ATPase in Speichervesikel des sarkoplasmatischen Retikulums moduliert. Die Interaktion von Phospholamban mit der cGMP-Kinase I β und dem IP3-Rezeptor Typ I konnte nach heterologer Expression der Komponenten in COS 7 Zellen bestätigt werden. Dazu wurde Phospholamban aus cDNA des Herzens der Maus kloniert und mit je einer der beiden Isoformen der cGMP-Kinase I α und β, dem IP3-Rezeptor Typ I und IRAG in COS 7 Zellen exprimiert. Weiterhin konnte die Assoziation des Komplexes an die zytoskelettalen Proteine α-Aktin und Calponin H1 gezeigt werden. Das Zytoskelett kann einerseits zur Stabilisierung des Komplexes im glatten Muskel beitragen. Andererseits kann der Komplex Membranproteine mitdem Zytoskelett verbinden und einen direkten Einfluss auf die Calcium unabhängige Kontraktion der Zelle haben. Als einzige Funktion von Phospholamban ist bisher die Regulation der Ca2+-ATPase beschrieben worden, daher wurde deren Assoziation an den funktionellen Komplex untersucht. Dazu wurde der Komplex an cGMP-Agarose gereinigt und nach Elution eine Co-Immunpräzipitation mit den spezifischen Antikörpern der Komplexbestandteile durchgeführt. Die differenzierte Auftrennung über zwei Säulen deckte die Existenz zweier Proteinkomplexe auf, die über das Zytoskelett miteinander verbunden sind. Einer besteht aus Phospholamban und der Ca2+-ATPase und steuert die Aufnahme von Calcium in intrazelluläre Speicher, der andere enthält einen geringeren Teil Phospholamban, die cGMP-Kinase I β und ihre Substrate IRAG und den IP3-Rezeptor Typ I. Dieser zweite Komplex reguliert wahrscheinlich den Calciumausstrom aus dem sarkoplasmatischen Retikulum.