Sequence within a gene or mRNA that does not code for the amino acid sequence of a protein
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Vad är ett bra anslag? Vad är det som gör att en första låt på ett album gör en sugen på att lyssna på resten? Vilken typ av cliffhanger eller beståndsdelar ska en pilot ha för att man ska bli sugen på att binge:a en tv-serie? I veckans Popkultur med Joseph pratar jag med serietecknaren Ditte Lindroth om starka intron. Är det bra eller dåligt med en voiceover? En liten chock som skakar om i början, kan det vara något? Vi går igenom favoriter i olika kategorier och försöker hitta gemensamma nämnare i de verk som fått oss att bara vilja ha mer. Utöver detta berättar jag om vägglössen jag utsattes för på min weekend i Amsterdam, Ditte om sitt seriemördarbeteende att uppskatta tystnad och andra härliga sidospår. Filmer som nämns: Maffiabröder, Submarine, Mandomsprovet, Harold å Maude, The Matrix, Mad Max: Fury Road, The Dark Knight, X-men 2, The Dawn of the Dead (2004), Lejonkungen, Guds Stad, Sagan om ringen: Härskarringen, Gudfadern. Låtar som nämns: Blur - Tender, Daft Punk - One More Time och The Rolling Stones - Sympathy for the Devil. Album som nämns: The Velvet Underground and Nico, Tame Impala - Currents, Håkan Hellström - Försent för Edelweiss TV-serier som nämns: Spung, Twin Peaks, Game of Thrones och Succession. Serieromaner som nämns: Scott Pilgrim VS the World, Prins Charles känsla och Joakim Von Ankas liv. Samt Dittes egna serieroman Flickvänsprovet som ni kan låna på biblioteket eller förslagsvis köpa i julklapp till flera vänner. Böcker som nämns: Min Kamp av Karl-Ove Knausgård och Harry Potter och de vises sten. Hemsidor som nämns: Tumblr, de mörka delarna av Flashback, Newgrounds, AlbinoBlackSheep och Weebls stuff. I avsnittet nämner jag att jag sjöng Tro & Tvivel i folks ansikten på Hultsfred/Stoxa 2013 och att många kunde den utantill trots att albumet bara hade varit ute i en månad. Jag blandade ihop Försent för Edelweiss (den kom ut 2008) med Det kommer aldrig vara över för mig (som kom ut 2013). Detta var dessutom på Hultsfred 2012, alltså året innan det senare albumet ens hade kommit ut. Men det är förvirrande att vara full och ung på festival så många år som jag har varit det på, så ni får ha lite överseende. Stötta Popkultur med Joseph på Patreon för exklusivt innehåll och annat skoj Följ mig på instagram, Letterboxd och twitter/X. Loggan är designad av Ante Wiklund Vinjetten är av Kalle Scherman och Gustav Ramsby
المصادر The Catalyst: RNA and the Quest to Unlock Life's Deepest Secrets By Cech, Thomas R. https://www.researchgate.net/figure/Human-cornea-structure-and-composition-A-Human-cornea-anatomy-B-The-human-cornea_fig1_379012868 https://www.genome.gov/genetics-glossary/Messenger-RNA-mRNA https://www.genome.gov/genetics-glossary/Transfer-RNA-tRNA https://www.genome.gov/genetics-glossary/Ribosome https://en.wikipedia.org/wiki/Ribozyme https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_RNAs https://www.salk.edu/news-release/modeling-the-origins-of-life-new-evidence-for-an-rna-world/ https://www.thoughtco.com/dna-versus-rna-608191 https://math.mit.edu/classes/18.417/index.html https://www.genome.gov/genetics-glossary/Nucleolus https://www.sciencefacts.net/rna-polymerase.html https://www.vedantu.com/biology/start-codons-in-dna-and-rna https://www.slideshare.net/slideshow/structure-and-function-of-messenger-rna-mrna/56603656 https://www.genome.gov/genetics-glossary/Intron https://rsscience.com/ribosomes/ https://earth.callutheran.edu/Academic_Programs/Departments/BioDev/omm/jsmolnew/trna/trna.html https://www.nist.gov/image/rnagraphics-introv2-01png https://en.wikipedia.org/wiki/Hammerhead_ribozyme
Bu bölümde 2024 Nobel Tıp veya Fizyoloji Ödülü'ne en yakın adayları masaya yatırıyoruz. Optogenetik mi şaperonlar mı bu yıl damgasını vuracak, yoksa İnsan Genom Projesi veya onkogenler mi? Artık bu işte ustalaştık, Nobel komitesi bizi dinleyip not alıyor olabilir!
Voice recognition is getting integrated in nearly all facets of modern living, but there remains a big gap: speakers of minority languages, and those with thick accents or speech disorders like stuttering are typically less able to use speech recognition tools that control applications, transcribe or automate tasks, among other functions. Learn more about your ad choices. Visit podcastchoices.com/adchoices
I månadens avsnitt pratar Axel och Emelie om sina bästa intron till en hel drös olika låtar. Vi pratar rock, minnen, instrument och har det bara jäkligt trevligt. Och det är tydligt att Axel och Läs mer …
Bu intron bölümümüzde uzun bir aradan sonra Nobel ödülü alan araştırmalarda karşımıza çıkan bir temadan, 'Serendipity' kavramından bahsettik. Keyifli dinlemeler!
Link to bioRxiv paper: http://biorxiv.org/cgi/content/short/2023.01.11.521585v1?rss=1 Authors: Bormann, A., Koerner, M. B., Dahse, A.-K., Glaeser, M. S., Irmer, J., Lede, V., Alenfelder, J., Lehmann, J., Hall, D. C. N., Thane, M., Schleyer, M., Kostenis, E., Schoeneberg, T., Bigl, M., Langenhan, T., Ljaschenko, D., Scholz, N. Abstract: Adhesion G protein-coupled receptors (aGPCR) function as metabotropic mechanosensors in the nervous system and other organs. aGPCR are heavily spliced forecasting an extraordinary molecular structural diversity. Many predicted isoforms lack the transmembrane (7TM) signaling subunit, but to what extent these non-GPCR isoforms are produced and what physiological purpose they serve is unknown. Alternative splicing through intron retention of ADGRL/Latrophilin/Cirl mRNA in Drosophila generates transcripts encoding unconventional proteins with an extracellular domain anchored by a single transmembrane helix (Cirl1TM). Here, we show that Cirl1TM transcripts are translated in vivo and that Cirl1TM binds Cirl7TM N-terminal fragment-dependently. This interaction enables mechanosensory neurons to distinguish input intensities through G(alpha)o-dependent signaling. Similarly, a direct interaction was found for mammalian GPR126/ADGRG6 isoforms. Together, our findings define intron retention and isoform-specific heteromerization as extraordinary molecular strategies to adjust Cirl-dependent mechanosensation and demonstrate physiological relevance of versatile aGPCR isoform repertoire to tune cellular responsiveness. Copy rights belong to original authors. Visit the link for more info Podcast created by Paper Player, LLC
https://psychiatry.dev/wp-content/uploads/speaker/post-9508.mp3?cb=1662659752.mp3 Playback speed: 0.8x 1x 1.3x 1.6x 2x Download: Truncated Tau caused by intron retention is enriched in Alzheimer’s disease cortex and exhibits altered biochemical properties – PubMed Zhen-Kai Ngian etFull EntryTruncated Tau caused by intron retention is enriched in Alzheimer's disease cortex and exhibits altered biochemical properties – PubMed
Räppiä savolaisilla juurilla ja vahvalla perinteisellä hiphop -estetiikalla tarjoileva Rösteri on kokoonpano, johon kuuluu Röllinäkin tunnettu Niko Nova, DJ Stedi & Riku Ryysyläinen. Rösterin nimikko-EP:n levyjulkkareita vietettiin kuopiolaisessa Ravintola Intro Socialissa 2.4.2022. Hetki ennen keikan alkua Johannes Teppo pääsi jututtamaan yhtyen jäseniä Intron bäkkärillä.
Episode #423! This week we are back talking more Cool Stuff from our world of pop culture. Image Comics founder Jim Valentino tells the history of his company with The Official Image Timeline. Scott spotlights the art book Intron Depot vol.1 by Shirow Masamune. DL talks a little bit about Frank Castle with the new Punisher #1 from Marvel comics. After that he focuses on The True Story of the Unknown Soldier by French comics legend Jacques Tardi from Fantagraphics. Check it out!
Uzun bir süre sonra herkese merhaba! Bu bölümde bu sessiz sedasız geçen ayların hesabını ve aynı zamanda gelecek ödül bölümlerinin sözünü verdik. Kayda geçsin :)
Merhaba! Bu intron bölümünde epeydir olmayışımızın nedenini, bilimsel aktivititelerimizi ve önümüzdeki gelişmeleri konuştuk. Bahsi geçen preprint: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.01.04.425128v1
Tällä kertaa etäyhteyden päähän saapui organisaatiopsykologi, insinööri ja tietokirjailija Ari-Pekka Skarp keskustelemaan tietoisuustaidoista. Keskustelussa avataan mitä tietoisuustaidoilla tarkoitetaan, mistä ne ovat peräisin ja millaisia vaikutuksia niiden harjoittamisella voi olla. Keskeisiä teemoja ovat mindfulness, keskittyminen, mielen refleksiivisyys, hengitys, effortless effort, tietoisuustaitojen ja flow'n suhde sekä henkisyyden monet polut. Jakson sivut: www.flow-akatemia.fi/podcast/ari-pekka-skarp-tietoisuustaidot-ja-flow Show notes: [01:00] Onko viikkoon kuulunut jo flow'ta? Lukemisen flow'sta. [08:00] Miten hahmotat flow'n? [14:20] Tietoisuus havainnoinnin kohteena [24:17] Mitä "hyötyä" tietoisuustaitojen harjoittamisesta on ollut? [32:08] Spiritual bypassing. Waking up, cleaning up, growing up [43:49] Ovatko tietoisuustaidot muuttaneet ihmisenä? [52:55] Harjoittelun moninaisuudesta. Mistä tutustumaan tietoisuustaitoihin? [60:00] Hengityksen merkityksestä[70:00] Mielen myrkyistä ja niihin vastaamisesta. Oman polun kulkemisesta.[80:00] Tietoisuustaidot ja flow'n kokeminen [96:00] Mitä tarkoittaa hiljaisuus liikkeessä, liike hiljaisuudessa? Wu weistä. [100:00] Miten valmistella virtausta? [113:00] Kenen kanssa haluaisit kokea flow'ta? Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Link to bioRxiv paper: http://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.09.22.309062v1?rss=1 Authors: Hogan, A. L., Grima, N., Fifita, J. A., McCann, E. P., Heng, B., Chan Moi Fat, S., Maharjan, R., Cain, A. K., Henden, L., Zang, K. Y., Zhao, Q., Zhang, Z.-H., Wright, A., Wu, S., Morsch, M., Yang, S., Williams, K. L., Blair, I. P. Abstract: Background: Splicing factor proline and glutamine rich (SFPQ, also known as polypyrimidine tract-binding protein-associated-splicing factor, PSF) is a RNA-DNA binding protein with roles in key cellular pathways such as DNA transcription and repair, RNA processing and paraspeckle formation. Dysregulation of SFPQ is emerging as a common pathological feature of multiple neurodegenerative diseases including amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Increased retention of SFPQ intron nine and nuclear loss of the protein have been linked to multiple genetic subtypes of ALS. Consequently, SFPQ dysregulation has been hypothesised to be a common pathological feature of this highly heterogeneous disease. Methods: This study provides a comprehensive assessment of SFPQ pathology in large ALS patient cohorts. SFPQ gene expression and intron nine retention were examined in multiple neuroanatomical regions and blood from ALS patients and control individuals using RNA sequencing (RNA-Seq) and quantitative PCR (RT-qPCR). SFPQ protein levels were assessed by immunoblotting of patient and control motor cortex and SFPQ expression pattern was examined by immunofluorescent staining of patient and control spinal cord sections. Finally, whole-genome sequencing data from a large cohort of sporadic ALS patients was analysed for genetic variation in SFPQ. Results: SFPQ intron nine retention was significantly increased in ALS patient motor cortex. Total SFPQ mRNA expression was significantly downregulated in ALS patient motor cortex but not ALS patient blood, indicating tissue specific SFPQ dysregulation. At the protein level, nuclear expression of SFPQ in both control and patient spinal motor neurons was highly variable and nuclear depletion of SFPQ was not a consistent feature in our ALS cohort. However, we did observe SFPQ-positive cytoplasmic ubiquitinated protein aggregates in ALS spinal motor neurons. In addition, our genetic screen of ALS patients identified two novel, and two rare sequence variants in SFPQ not previously reported in ALS. Conclusions: This study shows that dysregulation of SFPQ is a feature of ALS patient central nervous system tissue. These findings confirm SFPQ pathology as a feature of ALS and indicate that investigations into the functional consequences of this pathology will provide insight into the biology of ALS. Copy rights belong to original authors. Visit the link for more info
Link to bioRxiv paper: http://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.07.20.211557v1?rss=1 Authors: Tyzack, G. E., Neeves, J., Klein, P., Crerar, H., Ziff, O., Taha, D. M., Luisier, R., Luscombe, N. M., Patani, R. Abstract: Intron retention is known to regulate gene expression. We recently described intron retention as the predominant splicing programme characterizing early stages of motor neurogenesis from human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) and it's perturbation in familial amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Here, we sought to gain more insight into the nucleocytoplasmic distribution of aberrant intron-retaining transcripts (IRTs) and to identify their discriminating molecular features. We combined cellular fractionation with hiPSCs undergoing motor neurogenesis and deep-sequenced 95 samples: ALS vs control hiPSCs and nuclear vs cytoplasmic compartments across six timepoints, which represents a rich transcriptomic resource for basic and applied neuroscientists. Using this resource, we identified >100 aberrant cytoplasmic IRTs in cultures carrying ALS-causing VCP gene mutations. We taxonomized aberrant IRTs by their nucleocytoplasmic distribution and demonstrate that these classes exhibit sequence-specific attributes and differential predicted binding affinity to ALS-related RNA binding proteins. In summary we uncover a distinct class of cytoplasmic IRTs that serve as blueprints for established molecular hallmarks of ALS (nuclear-to-cytoplasmic mislocalisation of TDP-43, SFPQ and FUS) and therefore may also represent therapeutic targets. Copy rights belong to original authors. Visit the link for more info
Best of Källarpodden! Hej och välkomna till Norra Sveriges Roligaste Intro-podd Bli Patreon: https://www.patreon.com/kallarpodden Youtube: https://www.youtube.com/channel/UCMKc7v2KVTfS_AF1t_JUPBQ Källarpoddens hemsida: http://xn--kllarpodden-l8a.se/ Vill du/ni kontakta oss med ett ämne att prata om eller en annan synpunkt så kan du höra av dig till oss på sociala medier eller på kallarpodden@gmail.com
Lumilautailulegenda Eero Ettala saapui etäyhteyden päähän keskustelemaan flow'sta lumilautailussa. Jaksossa käsitellään muun muassa flow-tilaan pääsemisen edellytyksiä, Eeron suhdetta kipuun ja pelkoon, riskianalyysin ja oman taitotason tiedostamisen merkitystä sekä käytännön ohjenuoria oman tyylin löytämiseen. Yli kahdenkymmenen vuoden ammattilaisuran tuoma kokemus kuuluu selvästi ja vaikka lumilautailusta ei ymmärtäisi juuri mitään, ovat monet jaksossa nostetut oivallukset täysin releventtaja ja sovellettavia myös muissa yhteyksissä. Jakson sivut:www.flow-akatemia.fi/podcast/eero-ettala-lumilautailun-flow Show notes: [01:30] Mitä flow merkitsee [04:20] Millä tavoin flow eroaa eri ympäristöissä? [08:40] Flow kisoissa [10:50] Miten suhde jännitykseen, kipuun ja pelkoon on muuttunut? [17:05] Onko näyttämisen halu vaikuttanut taitotason ylittävien riskien ottamiseen? [21:45] Rennompi asenne ja flow [26:47] Tyyli ja flow [33:30] Onko lajin kehittymisen osasyynä urheilijavetoisuus valmentajavetoisuuden sijaan [40:20] Flow ja mahdottoman rajan venyttäminen [47:49] Miten preppaat haastavaa suoritusta varten [51:19] Ammattilaisuuden ja flow'n merkitys lumilautailussa [65:00] Neuvoja flow'n löytämiseksi [69:00] Loppuwräpit Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Tällä kertaa kytkeydyttiin etäyhteyden päähän keskustelemaan elämänasenteista ja flow'sta. Jakson alussa selvitetään fysiologian ja persoonallisuuden vaikutusta flow'n kokemiseen, jonka jälkeen avataan kenttä asenteille. Pohdinnassa käsitellään muun muassa asenteiden perustavanlaatuista vaikutusta elämänlaatuumme, millaisia eroja eri asenteilla tekemisen ilon ja tulosten kannalta sekä millaisilla suuntaviivoilla voi lähteä rakentamaan toimivaa, kestävää ja virtaavaa asennepohjaa. Podcastin loppupuolella jaetaan muutamia käytännön vinkkejä, joiden avulla voidaan tukea itselle sopivien asenteiden tutkimista ja omaksumista. Jakson sivut ja shownotesit: https://www.flow-akatemia.fi/podcast/elamanasenteet-ja-flow Show notes:[01:20] Miten persoonallisuus ja fysiologia vaikuttaa flow'hun?[13:25] Mikä asenteessa on olennaista?[18:20] Työ on seuraus asenteesta ja identiteetistä[22:20] Asenteen tiedostamisen merkityksestä[26:28] Asenne kulkee mukana kaikkialle[40:15] Millaiset asenteet mahdollistavat virtauksen?[52:50] Käytännön vinkkejä asenteisiin liittyen Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Tunteisiin-podcast, kausi 2, jakso 4: Palaute Mikä on palautteen ja kritiikin ero? Voiko kehua liikaa? Onko kaikki palaute pakko ottaa vastaan? Juuli ja Laura pohtii palautteen antamista ja vastaanottamista. Äänessä Juuli Ojansuu ja Laura Pullinen. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla menee tunteisiin. Uusi jakso joka maanantai! Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Entinen olympiapikaluistelija ja nykyinen mentori, puhuja ja yrittäjä Mika Poutala yhdistyi linjoille keskustelemaan muun muassa vauhdin flow'sta, merkityksen löytämisestä, itsensä ylittämisestä, pettymyksen käsittelystä, positiivisesta asenteesta ja uskosta. Monipuolisessa keskustelussa käydään läpi miten Mika suhtautuu haasteisiin rakentavasti, millaista on terve positiivinen asenne, miten auttaminen tuo merkitystä elämään ja miten henkisyys liittyy tähän kaikkeen. Jakson sivut: www.flow-akatemia.fi/podcast/mika-poutala-itsensa-ylittamisen-flow Mikan kotisivut: https://mikapoutala.fi Mikan podcast: Reflektoi ja Suunnittele Mikan Instagram ja Twitter: @mikapoutala Show notes: [02:50] Miten hahmotat flow'n? [03:30] Minkälaisten asioiden parissa pääse flow'hun? [08:10] Minkälainen laji on pikaluistelu ja mikä siinä vetoaa? [14:50] Syvimmät flow-kokemukset sekä uskon ja flow'n suhteesta [17:40] Miltä tuntuu kun putoaa flow'hun? [25:00] Lukemisesta ja ihmisenä kasvamisesta [28:35] Pettymysten käsittelystä ja identiteetistä [43:41] Sanojen voimasta, ajattelun ajattelusta ja asenteista [51:52] Miten henkisyys yhteydessä muiden auttamiseen [56:30] Mitä Mika nykytietämyksellään opettaisi nuoremmalle itselleen? [59:25] Mikä merkitys uskolla urheiluun? [65:55] Ongelmien ja haasteiden kohtaamisesta [71:11] Positiivisesta ajattelusta [77:10] Loppuwräpit Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Uusi Tunteisiin-kausi on täällä! Kausi 2, jakso 3: Häpeä Se pyyhkäisee yli kuin hyökyaalto, käy läpi koko kehon. Sisuskalut tuntuu painuvan kasaan. Sitten tulee lamaannus - mitä tapahtui? Lopulta tilanne voi päätyä hepuliin. Mutta entä jos jämähtääkin lamaannukseen? Mitä tapahtuu, jos häpeää ei pysty käsittelemään? Äänessä Juuli Ojansuu ja Laura Pullinen. Kiitokset tarinoiden jakamisesta myös Aliisalle! Toivottavasti tämä ei ollut nöyryytys. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla menee tunteisiin. Saatamme käsitellä tunteesi seuraavissa jaksoissa. Uusi jakso joka maanantai! Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
O-STUDIO. Suomen paras ja ainoa suunnistusaiheinen podcast on täällä! Intron jakso, johdatuksena suunnistuksen oman podcastin maailmaan. Esittelyssä juontajat Mikko Reitti, Kari-Pekka Seppänen ja Otto Simosas. Podcast pureutuu ajankohtaisiin aiheisiin sekä ilmiöihin, ja kutsuu vieraaksi mielenkiintoisia henkilöitä suunnistusurheilun syövereistä. Nostamme esiin aiheita, joita suunnistajien kahvipöydissä analysoidaan viikosta toiseen, mutta kukaan ei uskalla puhua niistä ääneen.
Media-alan ammattilainen, yrittäjä, valmentaja, kirjailija ja puhuja Anna Perho saapui etäyhteyden päähän keskustelemaan elämänhallinasta, ideoista, palautteesta ja vuorovaikutuksesta työelämässä. Jakson aikana käsitellään muun muassa oppeja ideoinnista, sitä kuinka suunnittelun avulla siirrytään reaktiivisuudesta proaktiivisuuteen, miten palautetta voidaan sekä antaa että vastaanottaa mahdollisimman virtaavasti ja kuinka tunteet liittyvät tähän. Jakson sivu ja shownotes: https://www.flow-akatemia.fi/podcast/anna-perho-ideoiden-ja-palautteen-flow Annan kotisivut: https://www.annaperho.fi/mina Annan instagram ja twitter: @annaperho [01:40] Aamu ja flow [08:19] Reaktiivisuudesta proaktiivisuuteen [11:38] Suunnittelun ja arvojen merkityksestä elämänhallinnassa [13:40] Minkälainen merkitys flow'lla omassa elämässä? [16:09] Minkälaisten asioiden parissa pääset parhaiten flow'hun? [18:24] Kuka tai ketkä ilmentävät parhaiten flow'ta? [22:16] Minkälaisia myyttejä liittyy palautteeseen? [25:45] Mitä huomioida palautteenannossa? [32:35] Inhmillisyys toimivan vuorovaikutuksen pohjana [35:50} Suoraan ja selkeästi asiaan, ymmärryksen merkitys palautteessa [40:30] Palautekeskusteluista ja niihin liittyvistä haasteista [46:52] Millaisia oppeja media-alalla toimiminen on tarjonnut viestintään ja ideointiin liittyen? [54:36] Miten uran aikana suhde omiin ideoihin on muuttunut? Miten ideat menevät käytäntöön? [67:18] Loppuwräpit Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Uusi Tunteisiin-kausi on täällä! Kausi 2, jakso 2: Voittaminen ja häviäminen Jos jokin menee tunteisiin, niin kilpaileminen! Vai? Kummalla menee, kummalla ei? Kumpi lähtee aina voittamaan, mutta häviön pelossa pelkää uusien asioiden yrittämistä? Kumpaa on jouduttu jopa kieltämään osallistumasta kilpailuihin, joissa ei voi menestyä? Äänessä Juuli Ojansuu ja Laura Pullinen. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla menee tunteisiin. Saatamme käsitellä tunteesi seuraavissa jaksoissa. Uusi jakso joka maanantai! Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Uusi Tunteisiin-tuotantokausi on täällä! Ensimmäisessä jaksossa tunteisiin menee hyvinvointipöhinä, puoskarointi ja huolestuttava huuhaa. Ruodittavaksi pääsevät motivaatiolauseet ja kuuden tonnin asiantuntijuus. Äänessä Juuli Ojansuu ja Laura Pullinen. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla meni tunteisiin. Käsittelemme tunteesi seuraavissa jaksoissa. Ehkä. Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Flow Akatemian podcastin (laita tilaukseen!) 4. jakso. Filosofi, tietokirjailija, tuottaja ja yrittäjä Lauri Järvilehto saapui keskustelemaan kanssamme oppimisesta, luovuudesta ja flow'sta niin yksilön kuin yhteisönkin tasolla. Jakson aikana tarkastellaan muun muassa Montessori-pedagogiikkaa, yksilölähtöistä oppimisen iloa, luovaa prosessia sekä flow'n ja haasteen suhdetta. Jakson aikana nostetaan tapoja luoda hyviä edellytyksiä luovuudelle sekä käydään läpi käytännön vinkkejä esimerkiksi parempaan brainstormaukseen. [02:20] Laurin musiikkitaustasta [04:45] Miten hahmotat flow'n? [05:30] Ihmisen luontainen tarve nostaa tehtävän haastavuustasoa [08:28] Päihteet ja flow [10:47] Taitojen harjoittaminen > Kemiallinen oikotie [12:15] Onko flowhakuisuus ollut merkittävästi osana elämää? [18:15] Montessoripedagogiikka ja oppimisen flow [24:25] Koulun kehittämisestä [30:10] Pänttäämisen rooli [32:45] Oppimisen ja täyttymyksen suhde [33:54] Erilaisia käytännön ja teorian lähestymistapoja oppimiseen ja opettamiseen [41:20] Mitä luovuus on? [45:00] Miten luovuutta voidaan tukea/jarruttaa? [46:34] Kyllä ja Ei luovuudessa [49:15] Anekdootteja rajan vetämisestä luovassa prosessissa [52:05] Hyvä ja huono brainstormaus [59:10] Miten edistää uusien ideoiden syntymistä? [60:39] Miten rakentaa luova flow? [63:00] Lapsen asenne ja asiantuntijaidentiteetin haasteet [67:00] Ryhmän flow [69:00] Loppuwräpit Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Filosofi, tietokirjailija, tuottaja ja yrittäjä Lauri Järvilehto saapui keskustelemaan kanssamme oppimisesta, luovuudesta ja flow'sta niin yksilön kuin yhteisönkin tasolla. Jakson aikana tarkastellaan muun muassa Montessori-pedagogiikkaa, yksilölähtöistä oppimisen iloa, luovaa prosessia sekä flow'n ja haasteen suhdetta. Jakson aikana nostetaan tapoja luoda hyviä edellytyksiä luovuudelle sekä käydään läpi käytännön vinkkejä esimerkiksi parempaan brainstormaukseen. [02:20] Laurin musiikkitaustasta [04:45] Miten hahmotat flow'n? [05:30] Ihmisen luontainen tarve nostaa tehtävän haastavuustasoa [08:28] Päihteet ja flow [10:47] Taitojen harjoittaminen > Kemiallinen oikotie [12:15] Onko flowhakuisuus ollut merkittävästi osana elämää? [18:15] Montessoripedagogiikka ja oppimisen flow [24:25] Koulun kehittämisestä [30:10] Pänttäämisen rooli [32:45] Oppimisen ja täyttymyksen suhde [33:54] Erilaisia käytännön ja teorian lähestymistapoja oppimiseen ja opettamiseen [41:20] Mitä luovuus on? [45:00] Miten luovuutta voidaan tukea/jarruttaa? [46:34] Kyllä ja Ei luovuudessa [49:15] Anekdootteja rajan vetämisestä luovassa prosessissa [52:05] Hyvä ja huono brainstormaus [59:10] Miten edistää uusien ideoiden syntymistä? [60:39] Miten rakentaa luova flow? [63:00] Lapsen asenne ja asiantuntijaidentiteetin haasteet [67:00] Ryhmän flow [69:00] Loppuwräpit Intron biitti: https://soundcloud.com/l-ba
Bu intron bölümümüzde, Nobel ödülleri hakkında ilginç istatistikler paylaşıyoruz. Hap şeklinde, suyla içilmesi gereken bilgiler.
Arki. Ei kiva. Toisaalta, Juuli ei enää arjen vuoksi pelkää kuolemaa. Se on hyvä. Ja miten liukuportaat ja puhtaat (valkeat) lakanat tähän liittyy? Sekava setti arjen ihmetyksiä. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla meni tunteisiin. Käsittelemme tunteesi seuraavissa jaksoissa. Ehkä. Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Historia toistaa taas itseään, kun Kulttuuritalo Annista ollaan häätämässä Porin kaupungin suojista lainsuojattomaksi. Tunteisiin meni! Kiitos vierailusta Tuomas! Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla meni tunteisiin. Käsittelemme tunteesi seuraavissa jaksoissa. Ehkä. Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Bu bölümde 2019 Nobel Tıp ödülleri üzerine konuştuk. Ödül günü yapacağımız canlı yayın hakkında biraz bilgi verdik.
Tosi-TV! Parasta vai pahinta? Ei väliä, mutta takuulla se menee tunteisiin. Kiitos podivierailusta Jaakko! Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä sulla meni tunteisiin. Käsittelemme tunteesi seuraavissa jaksoissa. Ehkä. Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Meidän eka IG-live nyt podimuodossa! Matkustimme melkein seitsemän tuntia junassa Mikkeliin. Tunteisiinhan se meni. Viskaa meitä viestillä Instagramissa @tunteisiinpodcast ja kerro, mikä meni tunteisiin. Käsittelemme tunteesi seuraavassa jaksossa. Intron musiikki: Trash FM by Alexander Nakarada
Bu bölümde en az Nobel ödülleri kadar ilginç bir ödülü, Ig Nobel ödüllerini konuştuk.
Bu bölümde de kaliteli boş yaptık. Konu konuyu açar diyenlere, muhabbet sevenlere, ortaya karışık!
Bu bölümde Koç Üniversitesi'nde bizimle beraber doktora yapan arkadaşımız sevgili Fidan Şeker'i konuk ettik. Onunla lisansüstü hayatı ve genel olarak bu bilimsel süreci irdeledik. Neymiş ya bu doktora!
Filmlerde ne kadar bilim var? Peki ya bilimlerde ne kadar film var? Filmlerin bilimsel yönlerini irdeledik.
Just an intro to what my podcasts are going to be about. ENJOY!!!
Klassiska tv-intron är ämnet för det här avsnittet.
Nu är vi äntligen tillbaka, idag kollar vi närmare på vilka tvserie intron som är dom bästa. Svårt att bara välja fem var och vi får villigt erkänna att vi glömde två riktiga klassiker. Pirate Rock no Pirate Rock, Antonina, Christian Pirate Rock Nu är vi äntligen tillbaka, idag kollar vi närmare på vilka tvserie intron som är dom bästa. Svårt att bara välja fem var och vi får villigt
Vi backar bandet till slutet av 80 talet och början av 90 talet. Idag bjuds ni på en gemensam topplista över tecknadeserie intron som påverkat oss som barn. Vi väljer varann låt och kör en 10 i topp. Pirate Rock no Pirate Rock, Antonina, Christian Pirate Rock Vi backar bandet till slutet av 80 talet och början av 90 talet. Idag bjuds ni på en gemensam topplista över tecknadeserie in
Ensimmäisessä jaksossa keskustelemme Ville Kinaretin kanssa. Ville on tunnettu radioääni, joka tällä hetkellä työskentelee Radio SuomiRockin aalloilla yhdessä juntajakollegoidensa Mikko Honkasen ja Shirly Karvisen kanssa. Tämän lisäksi Ville on perhestatuksen omaava muusikko, samoilija ja nyrkkeilyn harrastaja, joka stoalaisella elämänasenteellaan ottaa uusia paikkoja eksymällä haltuun. Villen kanssa juttelemme himanktalaisuudesta, isänä olemisesta, siitä miten Ville päätyi radioon töihin, nykynuorista ja monesta muusta aiheesta. Klikkaa ja kuuntele meidän keskustelu... ole hyvä! Intron musiikki: Kasimir Kantonen Promokuvat: Nana ja Juhana Simelius
Vincent speaks with 1993 Nobel Laureate Phillip A. Sharp about his career and his seminal discovery of RNA splicing in mammalian cells, which changed our understanding of gene structure. Hosts: Vincent Racaniello Guest: Phillip A. Sharp Become a patron of TWiV! Links for this episode Meet the Microbiologist Sharp Laboratory Spliced segments of adenovirus late mRNA (PNAS) Video of this interview (YouTube) This episode is brought to you by the Defense Threat Reduction Agency. Part of the U.S. Department of Defense, the Agency’s Chemical and Biological Technologies Department hosts the 2017 Chemical and Biological Defense Science & Technology Conference to exchange information on the latest and most dynamic developments for countering chemical and biological weapons of mass destruction. Find out more at http://www.cbdstconference.com Intro music is by Ronald Jenkees. Send your virology questions and comments to twiv@microbe.tv
Vi pratar om musik i tv-serier. Intron avhandlas men också om och i så fall vad musik spelar för roll i en serie.
Hosts: Nels Elde and Vincent Racaniello Nels and Vincent reveal how introns - the parts of pre-mRNAs that are removed by splicing - were generated by DNA transposons in two different picoeukaryotes. Become a patron of TWiEVO Introns from DNA transposons (Nature) Reverse transcription and integration lecture Image: Elde Lab Mobile Studios on location in Santa Fe, NM Letters read on TWiEVO 16 This episode is brought to you by Blue Apron. Blue Apron is the #1 fresh ingredient and recipe delivery service in the country. See what’s on the menu this week and get your first 3 meals free with your first purchase – WITH FREE SHIPPING – by going to blueapron.com/twie. Science Picks Nels - Did eukaryotes invent anything? (TWiM 144) Vincent - Virology course online Music on TWiEVO is performed by Trampled by Turtles Send your evolution questions and comments to twievo@microbe.tv
Den här veckan samtalar Snicksnack-panelen om intron, signaturer och teman. Helt enkelt allt ni velat veta om musiken som signalerar att det är dags att se på tv och liknande aktiviteter, men varit för rädda att fråga om. Dessutom: Stefan undervisar oss i olika livsåskådningar från USA, och vi svarar på en lyssnarfråga.
Hosts: Vincent Racaniello, Alan Dove, and Kathy Spindler Tre TWiV amici present three snippets and a side of sashimi: how herpesvirus inhibits host cell gene expression by disrupting transcription termination. Links for this episode Searching for Steamer in the oceans Lassa fever death in NJ (CDC and NYTimes) Transgenic mouse model for MERS-CoV (J Virol) First West Nile virus disease case in Texas Herpesvirus disrupts host transcription termination (Nat Comm) Sashimi plots Broad benefits of measles virus immunization (TWiM #104) Avian influenza outbreak (NPR) The virome in health and disease (Immunity) Image credit Letters read on TWiV 339 Weekly Science Picks Alan - Fooling millions into thinking chocolate helps weight lossKathy - Approaching PlutoVincent - ASM Agar art contest Listener Pick of the Week Daniel - FB pages you need to stop sharing from (one and two)Ken - Bird box science (canceled) Send your virology questions and comments (email or mp3 file) to twiv@twiv.tv
ICGEB 2nd Post-EURASNET Symposium "RNA Alternative Splicing"
Paula Duque Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras - PORTUGAL, Instituto Superior Técnico, Lisbon - PORTUGAL speaks on "An intron retention event in the 5’UTR of the novel ZIF2 membrane transporter regulates translation efficiency to promote zinc tolerance in Arabidopsis ". ICGEB 2nd Post-EURASNET Symposium “RNA Alternative Splicing” This seminar has been recorded at ICTP Trieste by ICGEB Trieste
Medizinische Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 16/19
Die Myotone Dystrophie Typ 2 (DM2) gehört, zusammen mit der Myotonen Dystrophie Typ 1 (DM1), zu den häufigsten erblichen Muskelerkrankungen des Erwachsenenalters. Sie wird autosomal dominant vererbt, ihre Inzidenz liegt bei 1:10.000 - 1:20.000. Die genetische Ursache der Myotonen Dystrophie Typ 2 ist ein abnorm expandiertes Tetranukleotid-CCTG-Repeat im Intron 1 des Zinkfinger-9-Gens (ZNF-9) auf Chromosom 3q21.3. Das kleinste, bisher in der Literatur beschriebene, Krankheitsallel zeigte eine Expansion von 75 CCTGs. Im Regelfall haben DM2-Patienten ein expandiertes Allel mit mehr als 5000 CCTG-Repeats. Die CCTG-Repeats akkumulieren in sog. ribonukleären Foci im Zellkern und im Zytoplasma. Dadurch kommt es zu Störungen in RNA-Prozessierungs- und Metabolisierungsvorgängen, wie dem alternativen Spleißen oder der Proteintranslation. Die vorliegende Arbeit beschreibt zum ersten Mal eine Phänotyp-Genotyp-Analyse von DM2-Patienten mit einem Repeat, kürzer als 75 CCTGs, sowie die Evaluation der Pathogenität dieser kurzen Repeats. Die Evaluation der Pathogenität geschah mithilfe verschiedener Nachweismethoden in Mus-kelbioptaten und in der genomischen DNA. Der Repeat-Nachweis im Muskelbioptat wurde einerseits immunhistochemisch mit monoklonalen Antikörpern gegen das CUG Bindungspro-tein 1 (CUGBP1) und gegen die Muscleblind-like Proteine 1-3 (MBNL1-3) geführt, anderer-seits mittels der Fluoreszenz in situ Hybridisierungstechnik unter Verwendung einer DNA-Sonde. Zur spezifischeren Detektion, der für die DM2-Erkankung typischen Repeat-Expansion, wurde eine PCR und eine Triplet-Repeat-Primed PCR angeschlossen. Des Weite-ren fand eine Sequenzierung der Blutproben der Patienten statt, zur möglichst genauen Analy-se der Repeat-Größe. In der vorliegenden Arbeit konnte der Repeat-Nachweis in den Muskelbioptaten mit den be-schriebenen Methoden bei allen untersuchten Patienten erfolgreich geführt werden. In den PCRs waren erhöhte Produkte nachweisbar. Die angeschlossene TP-PCR zeigte eindeutige Prämutationsmuster und die Sequenzierung der genomischen DNA ergab eine reproduzierbare Repeatlänge zwischen 32 und 36 CCTGs. In der Zusammenschau mit dem erhobenen Phä-notyp sind somit bereits CCTG-Repeat-Expansionen unter 75 CCTGs pathogen. Zur funktio-nellen Absicherung der Pathogenität wurde ergänzend eine Repeat-Untersuchung im Muskel durchgeführt und das für den Pathogenitätsnachweis etablierte CLCN1 splicing assay. Auch hier bestätigte sich die funktionale Relevanz dieser Mini-Repeat-Expansionen. Somit kann aufgrund der Untersuchungen dieser Arbeit die untere Grenze der als pathogen anzusehenden Repeat-Expansion bei der Myotonen Dystrophie Typ 2 auf eine Repeat-Anzahl von 35 CCTGs festgesetzt werden, die sich mit der von Normalallelen nahezu überlappt. Daraus ergeben sich bedeutende diagnostische und klinische Konsequenzen für Patienten mit neuromuskulären Erkrankungen und dem Verdacht auf eine Myotone Dystrophie Typ 2.
Fakultät für Biologie - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 04/06
Mon, 24 Jan 2011 12:00:00 +0100 https://edoc.ub.uni-muenchen.de/14130/ https://edoc.ub.uni-muenchen.de/14130/1/Cusimano_Natalie.pdf Cusimano, Natalie ddc:57
Medizinische Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 12/19
Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurden 855 Individuen mit Morbus Crohn, 481 Individuen mit Colitis ulcerosa und ein Kontrollkollektiv aus 1029 unverwandten, gesunden Individuen hinsichtlich drei verschiedener Einzelnukleotidpolymorphismen im Gen für den Toll-like Rezeptor 9 (TLR9) untersucht. Ziel war es, zu ermitteln, ob Assoziationen dieser SNPs mit Morbus Crohn oder Colitis ulcerosa oder mit klinischen Subtypen der beiden Erkrankungen vorliegen, und ob Interaktionen mit anderen krankheitsassoziierten Genen stattfinden. Es wurden für die vorliegende Arbeit drei Polymorphismen ausgewählt, mithilfe derer in Kombination mit den SNPs -1237 C/T und 2848 G/A, für die die Studienpopulation bereits typisiert war, zwischen den elf häufigsten beschriebenen 5-Punkt TLR9-Haplotypen differenziert werden kann. Es handelt sich dabei um die beiden Promotorpolymorphismen -1923 A/C und -1486 C/T sowie den Polymorphismus 1174A/G im Intron 1 des TLR9-Gens. Als wichtigstes Ergebnis der vorliegenden Arbeit kann eine hier erstmals beschriebene Assoziation des Polymorphismus 1174 A/G mit Colitis ulcerosa betrachtet werden. Für den SNP 1174 A/G konnte ein signifikant selteneres Auftreten des A-Allels bei Patienten mit Colitis ulcerosa gegenüber der Kontrollgruppe (p=0,035) oder Patienten mit Morbus Crohn (p=0,002) gezeigt werden. Signifikant war auch das seltenere Vorkommen des Genotyps AA bei Patienten mit Colitis ulcerosa (p=0,012 gegenüber Kontrollgruppe bzw. p=0,004 gegenüber Patientengruppe Morbus Crohn) Dies kann im Sinne eines protektiven Effekts des 1174 A/G A-Allels gegenüber Colitis ulcerosa interpretiert werden. Die im Rahmen dieser Arbeit beobachtete Assoziation des TLR9-Polymorphismus 1174 A/G mit Colitis ulcerosa kann als Hinweis darauf verstanden werden, dass TLR9 nicht nur, wie bereits beschrieben eine Rolle in der Pathogenese des Morbus Crohn spielt, sondern auch Bedeutung für die Colitis ulcerosa hat. Der Polymorphismus -1486 C/T scheint mit weiteren Suszeptibilitätsvarianten für Morbus Crohn zu interagieren, und das Krankheitsrisiko zu erhöhen. Es handelt sich hierbei jedoch um sehr schwache Effekte, so dass Aussagen über die Krankheitsrelevanz vor Ausschluss anderer Einflüsse (z.B. Kopplungsungleichgewichte) nicht getroffen werden können. Zusammen mit den Beobachtungen bzgl. Interaktionen zwischen dem Polymorphismus -1237 T/C im TLR9 und Polymorphismen im NOD2 und IL23R {Török, 2009}, unterstützen diese Ergebnisse aus genetischer Sicht jedoch eine Rolle von TLR9 in der Pathogenese Chronisch-entzündlicher Darmerkrankungen. Ein wichtiger Punkt bleibt allerdings die nähere Abgrenzung der funktionellen Relevanz der beschriebenen Assoziationen, was eine große Herausforderung für künftige Untersuchungen darstellt.
Professor Anna Marie Pyle discusses new findings about RNA processing and the form-function relationship of Group II introns and their evolution.
Tierärztliche Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 03/07
In dieser Studie wurde der genetische Defekt der 25-Hydroxyvitamin D3 1α-Hydroxylase (CYP27B1) der PVDR I-Schweine beschrieben. Diese Tiere stellen ein gutes Modell für die Pseudo-Vitamin-D-Mangel-Rachitis Typ I (PVDR I) dar. Die 1α-Hydroxylase ist ein Enzym, dass 25(OH)D3 zu seiner hormonellen Form aktiviert. Wie bei der echten Vitamin-D-Defizienz resultiert die Unfähigkeit Vitamin D3 zu aktivieren in Symptomen der Rachitis. Diese Tiere zeigen niedriege 1,25(OH)2D3-Blutspiegel, hochgradige Hypocalcämie, rachitische Veränderung des Skeletts und erhöhte Parathormon-Blutwerte. Diese Störung trat als spontane Mutation in den 60iger Jahren bei einer Zuchtlinie in Hannover auf. Wir konnten eine Splice-Site-Mutation in der Splice-Donor-Site von Intron 6 (IVS6+1G>A) ausfindig machen. In der cDNA von renalen und nicht-renalen Geweben wurde eine Deletion von Exon 6 gefunden, die in einem Frameshift und in einem verfrühten Stop-Codon resultiert. Zudem analysierten wir die Promotor-Region und die genomische Organisation des porcinen 1α-Hydroxylase-Gens bei dem eine hohe Homologie zum humanen 1α-Hydoxylase-Gen festgestellt wurde. Darüber hinaus wurde die Expression in der Niere und verschiedenen nicht-renalen Geweben, wie der uterinen Cervix, Haut, Lymphknoten, Nebenniere und dem Colon, ermittelt. Da alle Gewebe dieselbe defekte 1α-Hydroxylase exprimieren, gehen wir davon aus, dass das Enzym in den PVDR I-Schweinen enzymatisch inaktiv ist. Die Information über die Punktmutation wurde für die Entwicklung einer neuen, PCR-basierten Genotypisierungsmethode genutzt. Durch die Mutation wurde eine einmalig vorkommende Restriktionsschnittstelle für Bpu10I ausgelöscht, was die Genotypisierung mittels Restriktions-Längen-Fragment-Polymorphismus (RFLP) erlaubte. Zusätzlich etablierten wir eine Amplifikations-Refraktär-Mutations-System-PCR (ARMS), um die Genotypisierung von homozygoten, heterozygoten und Wildtyp-Genotypen zu vereinfachen. Die Expressionsspiegel der 1α-Hydroxylase wurden in einigen Geweben mittels quantitativer PCR in Wildtyp- und homozygoten Tieren bestimmt. In der Niere war die Expression gegenüber den Wildtyp-Tieren signifikant reduziert, wobei in der Haut keine Unterschiede gefunden wurden. Die Aktivierung von Blut-Makrophagen, mit Hilfe von Interferon γ, bewirkte einen Anstieg der 1α-Hydroxylase-Expression. Die regulatorischen Unterschiede in renalen und nichtrenalen Geweben wurden diskutiert. Diese Ergebnisse erlauben es das PVDR I-Schwein als Tiermodell für die Pseudo-Vitamin-D-Mangel-Rachitis Typ I nutzen zu können, um Studien der Regulation des Vitamin-D-Metabolismus und des Calciumstoffwechsels beim Schwein durchführen zu können.
Medizinische Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 02/19
Es gilt heute als gesichert, dass eine starke genetische Komponente in der Ätiologie der Schizophrenie vorliegt. In der vorliegenden Arbeit wurden in einer Fall-Kontroll-Assoziationsstudie drei genetische Polymorphismen in Genen des Interleukin-1-Genkomplexes auf eine mögliche Assoziation mit Schizophrenie untersucht: die Gene, die für die proinflammatorischen Interleukine Interleukin-1 alpha und Interleukin-1 beta kodieren, sowie das Gen, welches für den antiinflammatorischen Interleukin-1-Rezeptorantagonist kodiert. Dieser ist der natürlich vorkommende, endogene Gegenspieler von Interleukin-1. Seine biologische Funktion scheint in der Kontrolle des Ausmaßes der proinflammatorischen Interleukine zu liegen. Die in der vorliegenden Arbeit untersuchten Gene liegen innerhalb einer Genregion auf Chromosom 2p12-q22.1, die in einer groß angelegten Meta-Analyse als einziger Genabschnitt eine genomweite signifikante Kopplung erreichte (Lewis et al. 2003). Daher sind die Gene des Interleukin-1-Genkomplexes positionelle Kandidatengene in der Pathogenese der Schizophrenie. Außerdem sind die Interleukine deswegen sehr interessante Proteine für die Schizophrenie, da sie den Metabolismus von Neurotransmittern und die Hirnentwicklung beeinflussen sowie Informationen zwischen Zellen des peripheren Immunsystems und des zentralen Nervensystems vermitteln können. Im Blut, in der Zerebrospinalflüssigkeit sowie im präfrontalen Cortex schizophrener Patienten konnten veränderte Konzentrationen von IL-1 und IL-1RA im Vergleich zu Kontrollen beobachtet werden. Dies weist auf eine Dysregulation der Interleukine in der Schizophrenie hin. Da Anomalien bei der Hirnentwicklung, den Neurotransmittersystemen und dem Immunsystem als mögliche Pathomechanismen der Schizophrenie betrachtet werden, ist es durchaus vorstellbar, dass eine genetisch bedingte Störung in dem sensitiven Gleichgewicht zwischen pro- und antiinflammatorischen Interleukinen in der Schizophrenie zumindest teilweise krankheitsauslösend oder -beeinflussend sein kann. Für diese Fragestellung wurden Allel- und Genotypfrequenzen eines C-889T-Basenaustauschpolymorphismus im Promotor des Interleukin-1 alpha-Gens, eines C-511T-Basenaustauschpolymorphismus im Promotor des Interleukin-1 beta-Gens sowie eines variable number of tandem repeats (VNTR) -Polymorphismus im zweiten Intron des Interleukin-1-Rezeptorantagonist-Gens untersucht. In der vorliegenden Arbeit konnte keine Assoziation zwischen den untersuchten Polymorphismen der Gene des Interleukin-1 alpha und beta mit der Diagnose Schizophrenie festgestellt werden. Bei dem untersuchten Polymorphismus des IL-1RN konnte ein Trend in Richtung einer selteneren Häufigkeit des Allels 2 bei Schizophrenen nachgewiesen werden. Die Analyse von Haplotypen des IL-1-Genkomplexes auf Assoziation mit Schizophrenie ergab keinen Zusammenhang. Die vorliegenden Ergebnisse sprechen dafür, dass das seltenere Vorkommen des Allels 2 des IL-1RA bei den Schizophrenen einen Einfluss auf das Entstehungsrisiko der Schizophrenie haben könnte, indem es zu einer Verschiebung der sensitiven Balance des Interleukin-1-Genkomplexes zwischen pro- und antiinflammatorischen Interleukinen zugunsten der proinflammatorischen Interleukine führt. Dieser Befund bekräftigt die Hypothese, dass eine überschießende Aktivierung des Immunsystems in der Pathogenese der Schizophrenie eine Rolle spielen könnte. Außerdem weist er darauf hin, dass die Dysregulation der Interleukine bei den Schizophrenen zumindest teilweise genetisch bedingt sein könnte. Die Ergebnisse sprechen somit für eine mögliche schützende Rolle des Allels 2 des Interleukin-1-Rezeptorantgonisten vor der Entstehung der Schizophrenie. Dieser Befund wurde durch neuste Studien von Zanardini et al. (2003) und Bocchio-Chiavetto et al. (2002), in denen die Träger des IL-1RN Allel 2 signifikant seltener bei den Schizophrenen vertreten waren, unterstützt.
Medizinische Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 02/19
Die kongenitalen myasthenen Syndrome (CMS) bilden klinisch und pathogenetisch eine heterogene Gruppe von relativ seltenen hereditären Erkrankungen des Kindesalters. Sie werden durch unterschiedliche genetische Defekte im Bereich der neuromuskulären Endplatte verursacht und manifestieren sich mit variabler Symptomatik, bei der eine ermüdbare Muskelschwäche das herausragende Kennzeichen ist. Die exakte Klassifizierung eines CMS ist dabei neben dem wissenschaftlichem Interesse auch von klinischer Relevanz, da sich aus ihr für die betroffenen Patienten und ihre Familien unterschiedliche Konsequenzen hinsichtlich Prognose, Vererbbarkeit und pharmakologischer Therapie ergeben. In der vorliegenden Arbeit konnten post- und präsynaptische CMS verursachende genetische Defekte identifiziert werden. Dabei betreffen die meisten der nachgewiesenen Mutationen, analog zu anderen Untersuchungen, die epsilon-Untereinheit des nikotinergen Acetylcholinrezeptors (AChRepsilon). Einige Ergebnisse sind hierbei von besonderem wissenschaftlichem Interesse: Bei einer 1200bp großen Mikrodeletion auf dem ACHRepsilon-Gen handelte sich um die erste chromosomale Deletion, die bei CMS nachgewiesen werden konnte. Eine zusätzliche Mutation in der Promotorregion des ACHRepsilon-Gens (epsilon-154G/A) führt bei dem Patienten zur Manifestation des Krankheitsbilds. Bei einer Mutation an der Spleißakzeptorstelle von Intron 7 im ACHRepsilon-Gen (epsilonIVS7-2A/G), die bei insgesamt fünf Patienten aus drei unabhängigen Familien auftritt, konnte der fehlerhafte Spleißvorgang durch Analyse des resultierenden Transkripts aufgezeigt werden: Exon 7 wird, unter Verlust von Exon 8, direkt an Exon 9 gespleißt, aufgrund einer Leserahmenverschiebung entsteht ein vorzeitiges Stopcodon. Während die meisten Mutationen im ACHRepsilon-Gen nur bei einigen wenigen Patienten nachgewiesen werden, stellt die Mutation epsilon1267delG in der Volksgruppe der Roma die häufigste Ursache für CMS dar. Die relativ große Anzahl von Patienten mit dieser Mutation, die untersucht werden konnte, ermöglichte eine detaillierte Genotyp-Phänotyp-Korrelation. Zukünftig wird eine direkte Testung auf die Mutation epsilon1267delG die Diagnosestellung bei Patienten dieser Volksgruppe deutlich vereinfachen und beschleunigen. Darüber hinaus sollte diskutiert werden, ob aufgrund der hohen Carrier-Frequenz für diese Mutation ein Neugeborenen-Screening für die betroffenen Bevölkerungsgruppen angeboten werden sollte. Bei frühzeitiger Diagnosestellung können rechtzeitig Therapie- und Präventionsmaßnahmen eingeleitet werden, und bei entsprechender Medikation mit Acetylcholinesterase-Hemmern mögliche Komplikationen, wie Apnoe und plötzlicher Kindstod vermieden werden. Die Haplotypenanalyse von dieser Patienten mit der Mutation epsilon1267delG eröffnet neue Erkenntnisse über Ursprung und Verbreitung des mutierten Alleles in der Romabevölkerung. Es wurde ein Kernhaplotyp identifiziert, der auch bei Patienten aus Indien und Pakistan nachgewiesen werden konnte. Das gemeinsame Auftreten eines solchen Founder-Allels untermauert die, hauptsächlich auf sprachwissenschaftlichen Vergleichen beruhende These, daß die Vorfahren der Roma vom indischen Subkontinent stammen. Weitaus seltener als Mutationen im AChR treten Mutationen auf der präsynaptischen Seite der neuromuskulären Endplatte bei CMS auf. Im Gen für Cholin-Acetyltransferase (ChAT) konnte bei drei Patienten aus zwei unabhängigen Familien eine neue Mutation (CHAT I336T) homozygot nachgewiesen werden sind. Bei allen CHAT I336T Patienten wird, zusätzlich zu der myasthenen Symptomatik von einem, für Mutationen in diesem Gen typischen, gehäuften Auftreten von Apnoen, berichtet. Insgesamt bietet die molekulargenetische Analyse von CMS neben der Bedeutung, die sie für den einzelnen Patienten hat, die Möglichkeit das Verständnis der pathophysiologischen Zusammenhänge der neuromuskulären Übertragung zu erweitern.
Medizinische Fakultät - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 01/19
Der isolierte 3-Methylcrotonyl-CoA: Carboxylase (MCC) Mangel ist eine angeborene Störung im Abbau der Aminosäure Leucin. Es sind sowohl bis ins Erwachsenenalter asymptomatische als auch frühe letale Verläufe beschrieben. Die Ursachen des variablen Phänotyps sind nicht verstanden. Das Enzym ist zusammengesetzt aus α- und β - Untereinheiten. Die kodierenden humanen Gene MCCA und MCCB wurden kürzlich in unserer Arbeitsgruppe kloniert. Die Erweiterung des Neugeborenen-Screenings mittels Tandem-Massenspektrometrie in Bayern erbrachte die überraschende Erkenntnis, daß der MCC Mangel wahrscheinlich die häufigste organische Azidämie (etwa 1 : 40 000) darstellt und asymptomatische Mutationsträger existieren. Über Risiko und Prognose dieser metabolischen Störung ist derzeit noch keine Aussage möglich. In dieser Arbeit sollte daher eine Methode zur molekulargenetischen Charakterisierung von Patienten mit MCC Mangel etabliert werden, um den prognostischen Wert des Genotyps studieren und damit die Beratung und Betreuung der betroffenen Familien verbessern zu können. Es wurden 3 asymptomatische Patienten aus dem Neugeborenenscreening sowie ein Patient, der mit cerebralen Krampfanfällen aufgefallen war, untersucht. Die Diagnose war bei allen Patienten durch Bestimmung der typischen Metabolite in Urin (3-Hydroxyisovaleriansäure und 3- Methylcrotonylglycin) und Blut (3-Hydroxyisovaleryl-Carnitin) gestellt worden. Für die molekulargenetische Diagnostik des MCC Mangels wurde die Mutationsanalyse auf genomischer und cDNA Ebene für MCCA und MCCB etabliert. Es wurden zwei Patienten mit veränderten Allelen im MCCA- und zwei Patienten mit Mutationen im MCCB-Gen identifiziert. Ein Patient war compound-heterozygot für die Missense-Mutation S535F (1604C>T) und die Nonsense-Mutation V694X (2079delA) im MCCA Gen. Bei einem zweiten Patienten wurde S535F (1604C>T) heterozygot nachgewiesen. Ein Patient mit konsanguinen Eltern war homozygot für die Missense-Mutation S535F (1604C>T). Ein weiterer wies die Missense-Mutation E99Q (295G>C, cDNA: homozygot; gDNA: heterozygot) mit einen Allelverlust auf. In zwei Fällen werden zusätzliche Mutationen in der Promotorregion bzw. in einem Intron angenommen. Für alle gefundenen Mutationen kann von phänotypischer Relevanz ausgegangen werden. Drei davon waren bisher unbekannt und wurden von uns erstbeschrieben. Unsere Ergebnisse bestätigen die Rolle von MCCA und MCCB azielführende Methode zur molekulargenetischen Charkterisierung von Patienten mit MCC Mangel dar und bildet damit die Grundlage für Expressionsstudien und Studien zur Untersuchung der Genotyp-Phänotypkorrelation.ls humane Krankheitsgene. Die hier etablierte Mutationsanalyse stellt eine
Fakultät für Biologie - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 01/06
Im Unterschied zu den HLA-Klasse-Ia-Molekülen ist das nicht-polymorphe Klasse-Ib-Molekül HLA-G v.a. in der Plazenta exprimiert. Es wird postuliert, daß HLA-G die Immuntoleranz des mütterlichen Immunsystems gegen den „semiallogenen“ Fetus mitreguliert. In allen anderen Zellen und Geweben, in denen es gefunden wurde, ist die Menge im Vergleich zu klassischen Klasse-I-Molekülen um Größenordnungen geringer. Auch in der Genexpression unterscheidet sich HLA-G drastisch von allen übrigen Klasse-I-Molekülen. Am auffallendsten ist dabei das Auftreten verschiedener alternativer Spleißformen. Neben dem Volle-Länge-Transkript G1m gibt es eine Reihe verkürzter Isoformen: G2 (G2m, Da2-Domäne), G3 (Da2/Da3-Domäne), G4 (Da3-Domäne) sowie zwei Formen, die für lösliche Proteine kodieren, da die nicht-entfernte Intron-4-Sequenz zu einem vorzeitigen Translationsstop führt, G5 (G1s), G6 (G2s, Da2-Domäne, + In4). Die schwache Expression von HLA-G bestätigte sich auch für die im Rahmen dieser Arbeit untersuchten Haut- und Muskelbiopsien sowie Gehirnproben. Transkripte für HLA-G und die verkürzten Isoformen waren in fast allen Proben nachweisbar, wobei das Volle-Länge-Transkript die dominante Form war. Bei den nach Krankheitsgruppen eingeteilten Hautbiopsien und den Muskelbiopsien mit definierten Diagnosen konnte keine Korrelation eines bestimmten Expressionsmusters mit einer bestimmten Krankheitsgruppe bzw. Diagnose festgestellt werden. Diese Heterogenität des Expressionsmusters sowie die selektive Hochregulation der Volle-Länge-Isoform G1m auf Transkriptions- und Proteinebene in Glioblastomzellinien und Myoblasten, die nur eine äußerst schwache konstitutive Expression von HLA-G aufweisen, nach Behandlung mit IFNg deutet auf eine differentielle Regulation hin. Um die einzelnen Isoformen getrennt voneinander untersuchen zu können, wurden Transfektanten für jede Form in der Klasse-I-negativen B-Zellinie 721.221 etabliert. Nur die Volle-Länge-Isoform G1m sowie deren lösliche Variante G1s konnten auf der Zelloberfläche bzw. im Kulturüberstand nachgewiesen werden. Von den übrigen Isoformen konnten nur EndoH-sensitive Polypeptide gefunden werden, und auch Immunofluoreszenzfärbung mit einer Reihe von Klasse-I-Ak zeigte keine Zelloberflächenexpression. Es muß daraus geschlossen werden, daß die verkürzten Isoformen in der Zelle zurückgehalten werden. HLA-G kann auf zwei Wegen die Aktivität von Immuneffektorzellen regulieren: direkt über ILT2 und indirekt über HLA-E. Das MHC-Klasse-I-Molekül HLA-E wird durch Bindung eines Nonamers (P3-11) aus dem Signalpeptid verschiedener Klasse-I-Moleküle auf der Oberfläche von Zellen stabilisiert. Aus der Interaktion dieses funktionellen HLA-E/Peptid-Komplexes mit dem inhibitorischen Rezeptorkomplex CD94/NKG2A auf NK-Zellen resultiert ein Schutz dieser Zellen vor der NK-Lyse. Auch das entsprechende Peptid aus der Signalsequenz von HLA-G ist ein Ligand für HLA-E. Allerdings wurde gezeigt, daß die Stabilisierung von HLA-E auf der Zelloberfläche durch das Peptid G311 schwächer als mit anderen Klasse-I-Peptiden und auch weniger stabil ist. Effektive Inhibition der Lyse der NK-Zellinie NKL über diese Interaktion von HLA-E mit CD94/NKG2A findet man nur bei HLA-G1m-Transfektanten. Diese werden auch durch die direkte Interaktion von HLA-G1m mit einem weiteren inhibitorischen Rezeptor auf NKL - ILT2 - geschützt. In den 721.221-Transfektanten der verkürzten HLA-G-Isoformen war eine unphysiologisch hohe Konzentrationen an HLA-G-Polypetid notwendig, um die kritische Menge an HLA-E-Ligand für den Schutz dieser Zellen vor der Lyse durch NK-Zellen liefern zu können. Das war nur für eine äußerst stark exprimierende G3-Transfektante der Fall. Der Grund dafür liegt wahrscheinlich in einer ineffizienteren Prozessierung des Signalpeptids von HLA-G und einer im Vergleich mit anderen HLA-E-Liganden geringeren Bindungsaffinität des Peptids G3-11 für HLA-E. Eine Funktion der verkürzten HLA-G-Isoformen durch die direkte Interaktion mit Rezeptoren auf NK-Zellen konnte nicht nachgewiesen werden und ist wegen ihrer intrazellulären Expression auch unwahrscheinlich. Vielmehr deuten erste Daten, die zeigen, daß die Isoformen, direkt oder indirekt, mit dem TAP-Komplex assoziiert sind, auf eine mögliche Funktion im Rahmen der Antigenpräsentation hin. Worin diese besteht, müssen weiterführende Untersuchungen zeigen. Daher ist anzunehmen, daß HLA-G in vivo hauptsächlich über HLA-G-bindende KIR immunregulatorische Funktionen wahrnimmt und durch indirekte Wirkung über HLA-E-CD94/NKG2A modulierend eingreift.
Fakultät für Biologie - Digitale Hochschulschriften der LMU - Teil 01/06
Plasma-Kallikrein (PK) ist eine Serinprotease, die als inaktives Zymogen Plasma- Prokallikrein (PPK) in der Leber gebildet und in den Blutstrom sezerniert wird. Dort erfolgt die Konvertierung zum aktiven Enzym im Kontaktphasen-System der Blutgerinnung. Neben der Funktion im Kontakt-System spielt diese Protease sowohl in der Fibrinolyse als auch im Kallikrein-Kinin-System eine zentrale Rolle. Neuere Arbeiten haben gezeigt, dass PPKmRNA auch außerhalb der Leber exprimiert wird. Daraus ist zu schließen, dass dort ebenfalls PPK-Protein gebildet wird und dass diesem extrahepatischen, gewebeständigen PPK bzw. PK spezielle lokale Funktionen zukommen. Dieser Befund bildet die Grundlage dieser Dissertation. Mit dem langfristigen Ziel die physiologische und pathophysiologische Rolle des extrahepatisch gebildeten PPK aufzuklären, sollte in dieser Arbeit zunächst mittels einer quantitativen PCR-Technik (TaqMan) untersucht werden, in welchem Umfang PPK-mRNA und die mRNAs der übrigen Komponenten des Kontaktphasen-Systems in humanen Zellen bzw. Geweben exprimiert werden. Aufgrund dieser Ergebnisse sollte im zweiten Teil der Arbeit untersucht werden, ob bzw. inwieweit das PPK-Gen gewebespezifisch reguliert werden kann. Hierzu sollten die regulatorisch bedeutsamen Regionen des PPK-Gens charakterisiert werden. Mittels der TaqMan-Technologie konnte die PPK-mRNA-Expression in allen untersuchten humanen Geweben quantifiziert werden. In neun Geweben liegt die mRNA-Expression im Vergleich zur Leber zwischen 1 % und 68 % und in sechs Geweben zwischen 0,1 % und 1 %. Diese Ergebnisse sprechen für eine ubiquitäre, aber teils sehr unterschiedliche Expression der PPK-mRNA in humanen Geweben. Die mRNAs von hochmolekularem Kininogen (HK), niedermolekularem Kininogen (LK), Faktor XI (FXI) und Faktor XII (FXII) werden dagegen nur in wenigen Geweben exprimiert. Die Transkripte von HK, LK und FXI findet man außerhalb der Leber nur noch in Nierengewebe in signifikanter Menge, während FXII-mRNA nahezu ausschließlich in der Leber synthetisiert wird. Ein gemeinsames Merkmal aller Transkripte ist, dass sie in Lebergewebe am stärksten expimiert werden. Zellstimulationsversuche mit HepG2-Zellen ergaben, dass die PPK-mRNA-Synthese mittels Lipopolysacchariden (LPS) kurzfristig induziert werden kann, was für eine wesentliche Funktion von PPK bzw. PK bei Entzündungsreaktionen spricht. Im Gegensatz hierzu bewirkt Phorbol-12-myristat-13-acetat (PMA) eine Herabregulation der PPK-Transkription. Untersuchungen zur Stabilität der mRNAs von PPK und dem Haushaltsgen GAPDH mit den Transkriptionsinhibitoren Actinomycin D, α-Amanitin und DRB zeigten, dass die mRNAAbbaurate in HepG2-Zellen vom jeweils eingesetzten Transkriptionsinhibitor abhängt. Bei allen Transkriptionsinhibitoren wurde das PPK-Transkript im Vergleich zu GAPDH deutlich schneller (Faktor 3-5) abgebaut. Dies weist darauf hin, dass die PPK-mRNA-Spiegel in den Zellen durch ständige Neusynthese aufrechterhalten werden, um eine kontinuierliche Produktion von PPK zu gewährleisten. Mittels der RLM-RACE Methode wurden in Leber-, Pankreas-, Nieren- und Testisgewebe die PPK-Transkriptionsstartpunkte (TS) identifiziert. Während in der Leber und im Pankreas nur TSs in Exon 1 des PPK-Gens benutzt werden, findet man in Nieren- und Testisgewebe TSs sowohl in der upstream-Region als auch in Intron 1. Weiterhin wurden in Nierengewebe drei am 5´-Ende verkürzte PPK-Transkripte detektiert, die aufgrund dieser Deletion keine Signalpeptid- Sequenz enthalten und dadurch eine intrazelluläre Lokalisation der entsprechenden PPK-Isoform bedingen. Die Consensussequenz-Analyse für die Transkriptionsinitiation zeigt, dass jedem experimentell ermittelten Transkriptionsstart eine TATA-Box oder/und ein Initiator-Element assoziiert ist. Außerdem konnte durch die RLM-RACE-Analysen die Existenz eines weiteren untranslatierten Exons im 5´-Bereich des PPK-Gens ausgeschlossen werden. Unter Anwendung der Genome Walker Technik wurde die Promotorregion (P-1729) stromaufwärts von Exon 1 kloniert und mittels Reportergen-Studien analysiert. In HepG2-Zellen zeigt dieses Gensegment eindeutig transkriptionsaktivierende Kapazität. Durch die Generierung von neun Verkürzungsvarianten konnten der Core-Promotor (-158 bis +22), Enhancerbereiche (-1675 bis -1494) und Silencerregionen (-1304 bis -674) charakterisiert werden. Die Transkriptionsfaktoren-Analyse ergab, dass bei der Regulation durch die P-1729 Region neben ubiquitär exprimierten auch streng gewebespezifische Transkriptionsfaktoren eine zentrale Rolle spielen. Reportergen-Untersuchungen des Intron-1-Bereichs in HEK 293-Zellen zeigten, dass auch diese Region des PPK-Gens transkriptionsaktivierende Kapazität besitzt. Ebenso zeigt aber auch der P-1729 Bereich in HEK 293-Zellen Promotoraktivität. Somit können innerhalb eines Zelltyps beide Promotorbereiche funktionell aktiv sein, wodurch eine alternative Regulation der PPK-Transkription ermöglicht wird.
Tue, 1 Jan 1991 12:00:00 +0100 http://epub.ub.uni-muenchen.de/3054/ http://epub.ub.uni-muenchen.de/3054/1/024.pdf Messer, Gerald; Spengler, Ulrich; Jung, Maria C.; Honold, G.; Blömer, Kathi; Pape, Gerd R.; Riethmüller, Gert; Weiß, Elisabeth Messer, Gerald; Spengler, Ulrich; Jung, Maria C.; Honold, G.; Blömer, Kathi; Pape, Gerd R.; Riethmüller, Gert und Weiß, Elisabeth (1991): Polymorphic Structure of the Tumor Necrosis Factor (TNF) Locus: An NcoI Polymorphism in the First Intron of the Human TNF-ß Gene Correlates with A Variant Amino Acid in Position 26
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